PDBe CCDUtils 是一款专为处理和分析 PDB 中小分子而设计的多功能工具包，。该工具包能快速获取 PDB 中小分子的全部元数据。它利用 RDKit 计算多种属性，包括 2D 描述、 3D 构象和理化性质等。工具包还包含用于识别宏分子结构中共价连接化学组分的方法，并可计算小分子间的相似度。作为一款基于 RDKit 开发的...
目前,PDBe CCDUtils 能够解析和处理 mmCIF 格式的小分子参考文件(CCDs/PRDs),计划中包括将功能扩展到直接从 PDB 条目文件中处理小分子数据。 PDBe CCDUtils 在数据清理过程中有所限制,主要集中于处理金属原子相关的价问题。截至 2023 年 10 月 18 日,大约 0.5%(188/41,400)的化学组分在使用 PDBe CCDUtils ...
REMARK 200 DETECTOR TYPE : CCD REMARK 200 DETECTOR MANUFACTURER : ADSC QUANTUM 315R REMARK 200 INTENSITY-INTEGRATION SOFTWARE : XDS REMARK 200 DATA SCALING SOFTWARE : XSCALE, XDS REMARK 200 REMARK 200 NUMBER OF UNIQUE REFLECTIONS : 17966 REMARK 200 RESOLUTION RANGE HIGH (A) : 1.810 REMARK 200...
目前,PDBe CCDUtils 能够解析和处理 mmCIF 格式的小分子参考文件(CCDs/PRDs),计划中包括将功能扩展到直接从 PDB 条目文件中处理小分子数据。 PDBe CCDUtils 在数据清理过程中有所限制,主要集中于处理金属原子相关的价问题。截至 2023 年 10 月 18 日,大约 0.5%(188/41,400)的化学组分在使用 PDBe CCDUtils ...
目前,PDBe CCDUtils 能够解析和处理 mmCIF 格式的小分子参考文件(CCDs/PRDs),计划中包括将功能扩展到直接从 PDB 条目文件中处理小分子数据。 PDBe CCDUtils 在数据清理过程中有所限制,主要集中于处理金属原子相关的价问题。截至 2023 年 10 月 18 日,大约 0.5%(188/41,400)的化学组分在使用 PDBe CCDUtils ...
Example data files from the wwPDB for expansion of the CCD identifier length to greater than three characters 4 1 assembly-mmcif-examples Public Repository for sample biological assemblies in mmCIF form 1 validation-mmcif-examples Public Examples of wwPDB validation reports in mmCIF format ...
导读PDBe CCDUtils 是一款专为处理和分析 PDB 中小分子而设计的多功能工具包,。 该工具包能快速获取 PDB 中小分子的全部元数据。 它利用 RDKit 计算多种属性,包括 2D 描述、 3… 阅读全文 Python的调试器 究竟 引用:https://docs.python.org/zh-cn/3/library/pdb.html调试功能: 断点 单步执行 检视堆...
install(CODE "file(REMOVE ${OLD_CONFIG_FILES})") endif() if(CIFPP_DATA_DIR AND CIFPP_DOWNLOAD_CCD) install( FILES ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/rsrc/mmcif_ddl.dic ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/rsrc/mmcif_pdbx.dic ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/rsrc/mmcif_ma.dic ${COMPONENTS_CIF} DESTI...
0x4760ECCD: "__stdcall CryptCATHandleFromStore" _CryptCATHandleFromStore@4 0x4762B404: "__stdcall _imp__ASN1DecRealloc" __imp__ASN1DecRealloc@12 0x4762B1FC: "__stdcall _imp__CertGetCertificateChain" __imp__CertGetCertificateChain@32 0x4762B3D8: "...
#4 0x0000000000485fc2 in PyEval_EvalFrame (f=0x66ccd8) at ../Python/ceval.c:2163 ... 运气好的话,你可以直接看到问题出现在什么地方。如果它提供的信息不能直接帮你解决问题,你可以尝试继续追踪调用栈。调式的结果取决于 debug 信息的有效程度。