典型的乱用pdb2gmx 对于单纯的pdb->gro格式转换，把pdb载入最新版Multiwfn，主功能100的主功能2就能转...
在gromacs中输入gmx pdb2gmx -f hupisu.pdb -o hupisu.gro -water spce ，选择CHARMM27力场，出现...
我在chem3D里面获得丙酮的PDB格式,之后把文本复制到prodrg中,运行得到下面的页面,我再之后怎么做,这种方法得到的top和gro还需要注意什么?金币不多,跪求这方面指教,谢谢The PDB file (all hydrogens)REMARK REMARK REMARK This file was generated by PRODRG version AA100323.0717...
分为两个部分:1.lammps里将data文件,生成初始gro文件(并不是gromacs里最终的gro文件)2.gromacs里,将gro文件转换成pdb文件(这里的pdb是未加水的,并不是gromacs里最终的pdb文件), 视频播放量 1030、弹幕量 0、点赞数 9、投硬币枚数 11、收藏人数 15、转发人数 0, 视频
然后原路返回，通过Gromacs将gro格式转化为pdb格式，这时候将生成的pdb文件通过Materials Studio打开，结果...
利用命令pdb2gmx_mpi_d将四氢呋喃（醚类）转换为相应的gro文件并生成相应的ndx文件等，报错：Residue ...
然后原路返回，通过Gromacs将gro格式转化为pdb格式，这时候将生成的pdb文件通过Materials Studio打开，结果...
然后原路返回，通过Gromacs将gro格式转化为pdb格式，这时候将生成的pdb文件通过Materials Studio打开，结果...