接下来,我们使用factoextraR 包生成基于 ggplot2 的 PCA 结果可视化。 还有其他函数 [包] 可以在 R 中计算 PCA: 使用prcomp() [统计] res.pca <- prcomp(iris[, -5], scale. = TRUE) 阅读更多: http://www.sthda.com/english/wiki/pca-using-prcomp-and-princomp 使用princomp() [统计] res.pca <-...
## **Results for the Principal Component Analysis (PCA)** R语言内的PCA计算过程就结束了,代码还是很简单。 三、可视化和解释 我们将使用factoextraR 包来帮助解释PCA。无论您决定使用什么函数 [stats::prcomp()、FactoMiner::PCA()、ade4::dudi.pca()、ExPosition::epPCA()],您都可以轻松提取和可视化 PCA...
参考链接:R语言与数据分析之五:主成分分析(还有很多系列,慢慢看) 主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)的目标是用一组较少的不相关的变量代替大量相关变量,同时尽可能保留原始变量的信息,推导所得的变量就成为主成分,是原始变量的线性组合。也就是将N个变量(N维),通过线性组合,降维到K个综合变量(K维,K ...
R语言实现PCA分析逐步计算PCA分析中的参数prcomp函数princomp函数 自定义函数实现PCA分析及其可视化 咱们常提到的PCA分析全称是Principal Components Analysis,即主成分分析,这是降维中最常见的一种方法。我相信,数据维度大家应该都比较清楚,这里就不再一一赘述。因此,与大家分享下PCA分析的基本知识,以及如何利用R语...
test.pr<-princomp(test,cor=TRUE) #cor是逻辑变量,cor=TRUE 表示用样本的相关矩阵R做主成分分析若cor=FALSE 表示用样本的协方差阵S做主成分分析summary(test.pr,loadings=TRUE) #loading是逻辑变量,当 loading=TRUE 时表示显示 loading 的内容#loadings 的输出结果为载荷是主成分对应于原始变量的系数,即Q矩阵...
Welcome! Related Books: `Practical Guide To Cluster Analysis in R` at https:///13EFCZ 1. 2. 3. 我们将使用演示数据集decathlon2从factoextra包,数据集如下: data(decathlon2) head(decathlon2) 1. 2. A data.frame: 6 × 13 但我们只选择部分数据进行计算,处理如下: ...
「R」数据可视化11:PCA和PCoA图 其实不论是PCoA还是PCA图均是用散点图来展示结果PCoA和PCA的结果,PCoA和PCA准确来讲是数据降维分析方法。 什么是PCA和PCoA 主成分分析(Principal components analysis,PCA)是一种统计分析、简化数据集的方法。它利用正交变换来对一系列可能相关的变量的观测值进行线性变换,从而投影为...
主成分分析(Principle component analysis, PCA)前面我们已经用两期教程跟大家讲过理论和实际绘图(在线主成分分析Clustvis和主成分分析绘图)。今天,我们就从PCA的数理统计层面入手,去讲讲完整的PCA应该怎么操作。 总体而言,PCA是一种数据降维技巧,它能将大量相关变量转化为一组很少的不相关变量,这些无关变量就称为主成...
In this article, we'll dive into the fundamentals of PCA and its implementation in the R programming language. We'll cover important concepts, the use of the prcomp function in R, the significance of eigenvalues, and how to interpret the PCA results. Understanding Principal Component Analysis ...
Time Series Analysis using R: Tutorial Learn Time Series Analysis with R along with using a package in R for forecasting to fit the real-time series to match the optimal model. Salin Kc 16 min Tutorial R Formula Tutorial Discover the R formula and how you can use it in modeling- and gr...