记PAM250矩阵的自乘 1978年,Margaret Belle (Oakley) Dayhoff教授给出了一个PAM矩阵,这个矩阵实际上是一个概率表,就是每一个氨基酸突变成另一个氨基酸的概率是多少,由于没有足够多的序列和理想的比对算法,她选择了相似程度非常高(≥85%)的蛋白质序列集。在统计了1572个突变点之后,她总结出了每一个氨基酸突变成...
PAM250矩阵,就是PAM1矩阵自乘250次。 其他PAMn矩阵,也是PAM1矩阵自称n次。 PAM250矩阵 从突变概率矩阵到相关优势值矩阵 首先考虑一个问题,一个蛋白质通过可接受点突变形成的同源蛋白质,与一群氨基酸(氨基酸的比例符合图4所说的氨基酸在肽链中出现的概率)随机组合形成的蛋白质,这两种蛋白质之间,氨基酸序列,可能存...
PAM250矩阵是个概率表,由于序列比对过程中,一个氨基酸突变了,下一个氨基酸也突变,两个相邻的氨基酸同时的突变则是两个概率的乘积,不便于计算,Dayhoff就取了对数,换算成上面的样子,以后再有比对就直接相加分值就可以了。 让人费解的并不是PAM250矩阵的比值比取对数,而是她为什么让PAM1矩阵自身相乘250次,得到PAM250...
因为其所应用到的实体，两条序列没有先后顺序关系，亦即可以相互互换位置，所以对应的打分阵也必然要是可以自由转置而不会产生变化，自然就是对称阵了。
百度试题 题目3.PAM250矩阵定义的进化距离为两同源序列在给定的时间有多少百分比的氨基酸发生改变 () 相关知识点: 试题来源: 解析 80% 反馈 收藏
以下关于PAM矩阵的描述错误的是A.PAM250 是PAM1矩阵自乘250次后构建的矩阵B.PAM 是基于远源相关的蛋白所构建的可接受点突变矩阵C.PAM250 矩阵比PAM1矩阵更适合远源相关的序列比对D.PAM1 的生物学意义是,每100个残基中有1个可接受单点突变相关知识点: ...
在PAM250矩阵中,每100个残基中可能发生了250次可接受单点突变,因此有些位点上的残基可能都经过了多次改变,甚至可能变回到原先的氨基酸。A.正确B.错误
【单选题】PAM250 矩阵定义的进化距离为两同源序列在给定的时间有多少百分比的氨基酸发生改变 A、1% B、20% C、80% D、250% 单选其他 xrm2006 采纳率:46% 等级:9 已帮助:1313人 私信TA向TA提问 答案 芝士回答 来自: 芝士回答2022.02.23 芝士回答 已帮助:12443万人 已回答:422万条 靠谱的问答社区,专注分...
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局部比对应用pam250矩阵打分程序怎么写 在编写一个程序时，经常需要从外部读入数据，或者将程序运行的结果保存为文件。MATLAB使用多种格式打开和保存数据。本章将要介绍 MATLAB中文件的读写和数据的导入导出。13.1 数据基本操作 本节介绍基本的数据操作，包括工作区的保存、导入和文件打开。13.1.1 文件的...