截止到目前百迈客已拥PacBio平台:RS Ⅱ、PacBio Sequel、PacBio sequel Ⅱ;Nanopore 平台:PromethION-48、PromethION-β、Nanopore GridION、MinION,拥有了世界上最全的主流三代测序仪,尤其针对复杂超大基因组测序,百迈客具有超高的三代测序通量,以满足超大基因组的组装需求。
Pacific Biosciences公司周二发布了拟南芥(Arabidopsis thaliana)的数据集和de novo基因组组装结果,这是首次在新款测序仪Sequel系统上完成,利用了两个SMRT Cell,运行时间为12小时。 这不是PacBio第一次发布拟南芥的数据集。三年前,他们发布了Pac...
2010年:PacBio RS,3K,90M; 2013年4月:PacBio RS II,15万ZMW小孔,通量0.5~1G; 2015年:Sequel System,100万ZMW小孔,通量5~10G; 2019年4月:Sequel II,800万ZMW小孔,通量20~50G;hifi reads。 2020年10月:Sequel IIe,加入计算模块。 四、pacbio读长分布 五、pacbio测序仪器 六、目前pacbio测序系统 官网:h...
测序仪2013年PacBio公司三代测序仪RSII System,该系统基于革命性的SMRT测序技术,其平均读长达10,000 bp,最长读长超过20,000 bp。 此系统提供了简单快速的... Technologies。现在市场接受度和使用度最高的是Pacific Bioscience三代测序仪,其SMRT技术建立在两项革命性的发明基础之上,从而克服了测序领域的重大挑战。
PacBio RS是美国太平洋生物科学公司(Pacific Biosciences,http://www.pacb. com/)推出的单分子实时DNA测序技术(single molecular real time sequencing,SMRT),其主要特点是序列读长长,目前平均序列读长在10 kb以上,最长可达40 kb。PacBio RS采用单分子DNA合成测序技术,测序实验基本过程分为文库构建和上机两步。
测序平台:PacBio RSII 摘要 淡水生态系统中居住着世界性浮游细菌谱系的成员,尽管这些栖息地互不相连。谱系划分以>97%的16S rRNA基因序列相似性,但它们的谱系内微多样性和系统地理学,这是理解其普遍存在背后的生态进化过程的关键。为了解决这些问题,本研究首次采用针对近全长16S rRNA基因及其ITS区(~ 2000 bp)的单...
随着技术的不断进步,PacBio继续扩大其产品线。2016年,PacBio推出了Sequel系统,这是对前一代RS系统的显著提升,在读长、吞吐量和效率方面都有了显著提升。 此后,PacBio又在2019年和2020年分别推出了Sequel II和Sequel IIe高通量测序仪,进一步提高了测序精确度,并且与多个项目和公司展开合作,如SolveRD项目、All Of ...
RS II Sequel 在下机文件中,主要有三类文件,bam 文件,bam.pbi 文件,以及xml文件。 当我们习惯性的去寻找熟悉的fastq格式文件做分析时,忽然发现找不到了,因为在sequel平台中bam 文件成为了它的替代者,因为其更节约储存空间。这是文件格式的一个重大更新。
PacBio Sequel的SMRT Cell芯片相较上一代的RSII大了一些,样子变化也较大。 芯片上黑色柱状体用于机械臂插取、移动芯片。右下角的圆形凹槽为激光射入点,红绿混合激光从该点射入均匀的照射在金灿灿的芯片底部(图中闪着金光的矩形部分即为拥有100万个ZMW的测序芯片)芯片作为一个独立的无盖长方体反应槽的底部,机器臂...
福建农林大学Pacbio测序试剂(含RSII和sequel)成交公告 公告概要: 公告信息: 采购项目名称 Pacbio测序试剂(含RSII和sequel) 品目 货物/医药品/医用材料/非病人用诊断检验、实验用试剂/有衬背的诊断或实验用试剂 采购单位 福建农林大学 行政区域 福州市 公告时间 2017年