我们在生物数据统计分析中,经常会听到p-value,adjusted p-value,q-value以及False discovery rate(FDR)。比如最常见实验组和对照组的差异基因表达分析,除了获得一个p值(p-value),通常而言还会得到一个adjusted p-value或者FDR(false discovery rate)。那么他们之间到底有什么关系,为什么已经有了一个p-value来指征显...
这是我们最常用的校正P-value控制假阳性率的方式。假设针对10000个基因进行了统计检验,对所有的原始P-value进行由小到大的排序分别为p1, p2, ..., p10000,校正后的FDR为:p1*10000/1, p2*10000/2, ..., p10000*10000/10000。与Bonferroni correction一致的地方是都乘以了检测总数,不一致的地方是BH算法在此...
在统计学中，P-value、q-value和FDR是多重假设检验中的关键概念，它们分别涉及单次检验的错误率、整体错误率控制以及允许假阳性的调整。审稿人常常强调的多重假设检验校正，主要是为了控制Family Wise Error Rate（FWER，即假阳性率）或False Discovery Rate（FDR），以确保结果的可靠性。文章详细解释了单...
BH法有时也称fdr法,是我们最常用的多重假设检验校正方法,可以很好的控制假阳性率和维持统计检出力。R函数p.adjust可用来计算一组p-value校正后的fdr值。(DESeq2中返回的padj也是用BH方法控制的FDR) q-value是什么? q-value是Storey和Tibshirani提出的基于p-value分布的FDR计量方法,具体见什么,你算出的P-value看...
一文了解P-value，多重比较，FDR和Qvalue的差别 ⼀⽂了解P-value，多重⽐较，FDR和Qvalue的差别 ⾸先交代⼀下⽤来说明这⼏个统计量的例⼦。这⾥会使⽤基因表达作为⼀个例⼦。假设我们有两组细胞：对照组和处理组。我们正在研究基因 A 在处理的条件下是否受到表达或没有表达。每组我们有 12...
BH法有时也称fdr法,是我们最常用的多重假设检验校正方法,可以很好的控制假阳性率和维持统计检出力。R函数p.adjust可用来计算一组p-value校正后的fdr值。(DESeq2中返回的padj也是用BH方法控制的FDR) q-value是什么? q-value是Storey和Tibshirani提出的基于p-value分布的FDR计量方法,具体见什么,你算出的P-value看...
pvalue(pval): 统计学差异显著性检验指标。qvalue(p-adjusted): 校正后的p值（qvalue=padj=FDR=Corrected p-Value=p-adjusted），是对p值进行了多重假设检验，能更好地控制假阳性率。校正后的p值不同的几种表现形式，都是基于BH的方法进行多重假设检验得到的。校正后的p值不同的展现形式是因为...
The q value would be the probability of the world ending given the observation of an event as catastrophic as a meteor heading towards Earth. In this case, the q-value, rather than the p-value answers a much more natural question. It makes substantially more intuitive sense to be ...
一般GO富集分析后会看到这样的表格，第一列表示GO的三个levels，ID表示 GO数据库ID，Decription：表示该GO term的功能描述，GeneRAatio：富集到该term里的差异基因数/全部差异基因数，BgRatio：该term的全部基因数/该物种全部有GO注释信息的基因数，pvalue是p值，p.adjust表示矫校正过的p值，qvalue是q值，geneID...
(109条消息) p-value,p-adjust,q-value三者的定义与使用_小C_先生的博客-CSDN博客_adjust p value (109条消息) p-value,q-value,FDR_hyena_7的博客-CSDN博客_pvalue和qvalue区别 假阴性错误(false-negative errors) : 高 水平的基因可能偶尔 没有 检测到 假阳性错误(false-positive errors) : 低 水...