在统计学中，P-value、q-value和FDR是多重假设检验中的关键概念，它们分别涉及单次检验的错误率、整体错误率控制以及允许假阳性的调整。审稿人常常强调的多重假设检验校正，主要是为了控制Family Wise Error Rate（FWER，即假阳性率）或False Discovery Rate（FDR），以确保结果的可靠性。文章详细解释了单...
BH法有时也称fdr法,是我们最常用的多重假设检验校正方法,可以很好的控制假阳性率和维持统计检出力。R函数p.adjust可用来计算一组p-value校正后的fdr值。(DESeq2中返回的padj也是用BH方法控制的FDR) q-value是什么? q-value是Storey和Tibshirani提出的基于p-value分布的FDR计量方法,具体见什么,你算出的P-value看...
一文了解P-value，多重比较，FDR和Qvalue的差别 ⼀⽂了解P-value，多重⽐较，FDR和Qvalue的差别 ⾸先交代⼀下⽤来说明这⼏个统计量的例⼦。这⾥会使⽤基因表达作为⼀个例⼦。假设我们有两组细胞：对照组和处理组。我们正在研究基因 A 在处理的条件下是否受到表达或没有表达。每组我们有 12...
pvalue(pval): 统计学差异显著性检验指标。qvalue(p-adjusted): 校正后的p值（qvalue=padj=FDR=Corrected p-Value=p-adjusted），是对p值进行了多重假设检验，能更好地控制假阳性率。校正后的p值不同的几种表现形式，都是基于BH的方法进行多重假设检验得到的。校正后的p值不同的展现形式是因为...
The q value would be the probability of the world ending given the observation of an event as catastrophic as a meteor heading towards Earth. In this case, the q-value, rather than the p-value answers a much more natural question. It makes substantially more intuitive sense to be ...
大意似乎是,Storey把最小FDR当做qvalue? q-value是什么? 使用FDR校正得到的p-adjust即为q-value。 clusterProfiler包中的enrichKEGG函数和enrichGO函数用的什么方法? p-adjust clusterProfiler包中的enrichKEGG函数和enrichGO函数的默认p值校正方法为BH法 qvalue ...
一般GO富集分析后会看到这样的表格，第一列表示GO的三个levels，ID表示 GO数据库ID，Decription：表示该GO term的功能描述，GeneRAatio：富集到该term里的差异基因数/全部差异基因数，BgRatio：该term的全部基因数/该物种全部有GO注释信息的基因数，pvalue是p值，p.adjust表示矫校正过的p值，qvalue是q值，geneID...
(109条消息) p-value,p-adjust,q-value三者的定义与使用_小C_先生的博客-CSDN博客_adjust p value (109条消息) p-value,q-value,FDR_hyena_7的博客-CSDN博客_pvalue和qvalue区别 假阴性错误(false-negative errors) : 高 水平的基因可能偶尔 没有 检测到 假阳性错误(false-positive errors) : 低 水...
Understanding q-values as a More Intuitive Alternative top-valuesPatrick KimesAdviser: Professor Jo HardinApril 10, 20091 阅读了该文档的用户还阅读了这些文档 10 p. 医学影像学复习资料(1) 9 p. 医学英语词汇常用词根和词缀(1) 5 p. 外总复习题(4) 11 p. 康复医学复习重点功劳版(杨) 23 ...
q-value是Storey和Tibshirani提出的基于p-value分布的FDR计量方法,具体见什么,你算出的P-value看上去像齐天大圣变的庙?。 如何尽量减少统计检验次数 我们看到上面的校正方法多于统计检测次数有关,统计检测次数越多,校正也会越强烈。有没有合适的办法来规避一些无意义的统计检验呢?