这是我们最常用的校正P-value控制假阳性率的方式。假设针对10000个基因进行了统计检验,对所有的原始P-value进行由小到大的排序分别为p1, p2, ..., p10000,校正后的FDR为:p1*10000/1, p2*10000/2, ..., p10000*10000/10000。与Bonferroni correction一致的地方是都乘以了检测总数,不一致的地方是BH算法在此...
在一份普林斯顿大学的关于Storey_FDR方法的讲义中发现了一段关于Storey法计算qvalue的讲解(Storey本人写的。qvalue包的vignettes引用了这篇文章): 大意似乎是,Storey把最小FDR当做qvalue? q-value是什么? 使用FDR校正得到的p-adjust即为q-value。 clusterProfiler包中的enrichKEGG函数和enrichGO函数用的什么方法? p-a...
在统计分析中,p-value、p-adjust和q-value是三个关键概念,它们在检验假设和控制错误率中扮演重要角色。p-value是一个在假设检验中使用的统计量,它衡量在原假设(H0)成立的前提下,观察到特定结果的概率。当p值小于预先设定的阈值(如0.05),这暗示观察结果可能不支持H0,倾向于接受备选假设(H1...
生物数据统计分析中,p-value、adjusted p-value、q-value和False Discovery Rate (FDR) 是几个关键的概念,它们在判断实验组与对照组差异显著性时起着重要作用。虽然p-value直观地表示在假设H0(不存在差异)为真时,观察到数据的概率,但它可能受到多重假设检验的影响,导致假阳性结果。为了解决这个问...
⼀⽂了解P-value,多重⽐较,FDR和Qvalue的差别 ⾸先交代⼀下⽤来说明这⼏个统计量的例⼦。这⾥会使⽤基因表达作为⼀个例⼦。假设我们有两组细胞:对照组和处理组。我们正在研究基因 A 在处理的条件下是否受到表达或没有表达。每组我们有 12 个重复。我们通常做的是取每组 12 个重复的平均...
pvalue(pval): 统计学差异显著性检验指标。qvalue(p-adjusted): 校正后的p值(qvalue=padj=FDR=Corrected p-Value...
p-value就是算出这个统计量所代表的在原假设为真的前提下的一个指标,根据小概率事件原则,这个指标不...
方差分析中P-value和F-crit是什么960化工网专业团队、用户为您解答,有方差分析中P-value和F-crit是什么的疑问
p代表数字位长度 即整数部分和小数部分的数字位之和 q代表小数位
双尾检测 双尾P值