S-plot 是一种常用的可视化工具,用于在OPLS-DA(或PLS-DA)分析中鉴定那些对类别区分最有贡献的变量。S-plot 结合了负荷值和相关系数,变量以一种易于解释的方式展示。以下是进行 S-plot 分析基本步骤: 1.数据准备: 首先,需你需要一个已经通过 OPLS-DA 分析的数据集,包括各个变量(比如代谢物、基因表达水平等)的...
当使用S-plots从PLS-DA或OPLS-DA模型中筛选 p 值小于 0.05 的变量时,可以遵循以下的一些步骤: 1.建立模型: 首先,需要在适当的统计软件或编程环境(如 R、MATLAB 或 Python)中完成 PLS-DA 或 OPLS-DA 分析。 2.生成S-plot: 使用分析工具,基于已建立的模型生成 S-plot。该图展示了变量的协方差和相关性系数...
结果图2:OPLS-DA的S-plot图 S-plot 图的横坐标表示主成份与代谢物的协相关系数,纵坐标表示主成份与代谢物的相关系数。 S-plot 图一般用来挑选与OSC过程中主要成分的相关性比较强的代谢物,从另一方面同时也可以挑选与Y相关性强的代谢物。越靠近两个角的代谢物重要度越强。红色的点表明这些代谢物的VIP值大于等...
横坐标反映组间差异;纵坐标反映组内差异。 2-OPLS-DA的S-plot图 越靠近两个角的代谢物重要度越强。红色的点表明这些代谢物的VIP值大于等于1 , 绿色的点表示这些代谢物的VIP值小于等于1。 3-OPLS-DA的模型验证permutation Test图 模型验证 permutation Test 图的横坐标表示模型的准确率,纵坐标表示200次 permutat...
OPLS-DA：正交篇最小二乘法判别分析 原理：结果图1：OPLS-DA得分图：结果图2：OPLS-DA的S-plot图 结果图3：OPLS-DA的模型验证 permutation Test图
2-OPLS-DA的S-plot图 越靠近两个角的代谢物重要度越强。红色的点表明这些代谢物的VIP值大于等于1 , 绿色的点表示这些代谢物的VIP值小于等于1。 3-OPLS-DA的模型验证permutation Test图 模型验证 permutation Test 图的横坐标表示模型的准确率,纵坐标表示200次 permutation Test 中200个模型的准确率的频数,箭头...
OPLS-DA (S-plot) of C. deserticola and C. tubulosa.Sihao, Zheng
OPLS-DA分析中，S-plot图帮助识别与主成分和分类相关性强的代谢物，同时评估模型的R2X、R2Y和Q2值，反映模型对X和Y矩阵的解释率以及预测能力。验证图通过permutation test确定模型的最优性。要进行PCA、PLS-DA、OPLS-DA分析，可以使用如MetaboAnalyst这样的在线平台，它提供从数据预处理到模型构建和图形...
图3 OPLS-DA S-plot [3].OPLS-DA的模型验证permutation Test图 模型验证permutation Test图的横坐标表示模型的准确率,纵坐标表示200次permutation Test中200个模型的准确率的频数,箭头表示本OPLS-DA模型准确率所在的位置,其中R2X和R2Y分别表示所建模型对X和Y矩阵的解释率,Q2标示模型的预测能力,理论上R2、Q2数值...
The invention discloses fried mushroom bean curd. The fried mushroom bean curd is prepared from the following raw materials in parts by weight: 120-140 parts of soybeans, 15-20 parts of semen juglandis, 10-12 parts of mushroom, 6-8 parts... 麻志刚 被引量: 1发表: 2013年 Improvement of...