1) 把卡诺热机数学处理:工质属性,规律是物理方程,热源的温度是方程的数学边界。 卡诺定律表述为:2)...
我用的是OPLSAA力场,gromacs包含了Jorgensen开发的力场参数,但是我这个参数的原子类型有一部分是来自于别人...
我想用opls-aa力场模拟P3HT:PCBM的薄膜形貌,PCBM的top文件的立场参数是用附件文章中所提供的,其中有个...
楼主,这不是gromacs里带的吗?你这个有什么特别呢?
在charmm力场和和oplsaa力场都有定义并且func都是1的话,那么这种化学键在这两种力场里面的参数,是相同...
PDB文件,这个用GaussView之类的分子建模工具都可以建),就会生成对应的OPLS-AA力场参数文件,适用于不同...
我用的是OPLSAA力场,gromacs包含了Jorgensen开发的力场参数,但是我这个参数的原子类型有一部分是来自于别人...
tinker里也有很多力场参数
隔壁 @刘书乐提供了OPLS-AA的参数生成网站,可参考。还有就是推荐GAFF力场和Generalized Charmm力场,这俩...