不同于主成分分析( PCA)法,Partial Least Squares Discrimination Analysis,(PLS-DA)或 Orthogonal PLS-DA,(OPLS-DA)是一种有监督的判别分析统计方法。该方法运用PLS-DA建立代谢物表达量与样品类别之间的关系模型,来实现对样品类别的预测。分别建立两两分组比较的PLS-DA模型(图1)或OPLS-DA模型(图2),模型得到的...
不同于主成分分析(PCA)法,Partial Least Squares Discrimination Analysis(PLS-DA)或Orthogonal PLS-DA(OPLS-DA)是一种有监督的判别分析统计方法。该方法运用PLS-DA建立代谢物表达量与样品类别之间的关系模型,来实现对样品类别的预测。分别建立两两分组比较的PLS-DA模型(图1)或OPLS-DA模型(图2),模型得到的参数评价...
其中T O是与Y正交成分的得分矩阵,P T O是与其对应的载荷矩阵。 第二步,对X P进行偏小二乘分析。 图1 OPLS的概述图 1.OPLS-DA图表简述 [1].OPLS-DA的得分图 OPLS-DA 得分图的横坐标表示OSC过程中的主要成分的得分值(Tp),所以从横坐标的方向可以看到组间的差异;纵坐标表示 OSC过程中的正交成分的得分值...
载荷矩阵(loadingMN):代谢物在各轴中的坐标 模型评估 执行PLS统计建模时,一般会同时给出4个图片: image.png PLS-DA model of the gender response 显著性诊断(左上):实际和模拟模型的R2Y和Q2Y值经随机排列后的散点图,模型R2Y和Q2Y(散点)大于真实值时(横线),表明产生过拟合2。
其中TO是与Y正交成分的得分矩阵,PTO是与其对应的载荷矩阵。 第二步,对XP进行偏小二乘分析。 图1 OPLS的概述图 1.OPLS-DA图表简述 [1].OPLS-DA的得分图 OPLS-DA得分图的横坐标表示OSC过程中的主要成分的得分值(Tp),所以从横坐标的方向可以看到组间的差异;纵坐标表示OSC过程中的正交成分的得分值(TO);所以...
- 根据OPLS-DA分析结果,设计后续实验以验证关键代谢物的功能和机制。- 可能包括实验验证、临床样本测试或进一步的机理研究。OPLS-DA是一种综合了PLS-DA和OSC的分析方法,它通过逐步分析和模型验证,有助于在复杂数据集中识别和解释与特定响应变量相关的模式和关系。四、结果解读 - 得分图:OPLS-DA得分图展示了样本...
PLS-DA/OPLS-DA二维图产地:北京; 品牌:百泰派克 产品描述 不同于主成分分析( PCA)法,Partial Least Squares Discrimination Analysis,(PLS-DA)或 Orthogonal PLS-DA,(OPLS-DA)是一种有监督的判别分析统计方法。该方法运用PLS-DA建立代谢物表达量与样品类别之间的关系模型,来实现对样品类别的预测。分别建立两两...
simca OPLS-DA图表全集合多重验证和数据解析生信和挥发性物质检测必学,simca标准作图及数据解析,得分图、载荷图、DmodX、VIP、S-plot、置换检验,圈圈的宝箱回复601 教学视频,提供软件,讲解模型数据分析方法 #simca #oplsda #论文 #毕设 #SCI #作图 #检测 #生信
输入组学表格数据及分组信息,一键完成OPLS-DA分析,还能输出超多结果表格和图片?!快来看看鼠小弟的操作吧! 0 正交偏最小二乘法判别分析(Orthogonal Partial Least-Squares Discriminant Analysis)是一种统计学方法,它结合了正交信号矫正(OSC)和PLS-DA方法,能够将X矩阵分解成与Y相关和不相关的两类信息,通过去除不相关...
其中TO是与Y正交成分的得分矩阵,PTO是与其对应的载荷矩阵。 第二步,对XP进行偏最小二乘分析。 图1 OPLS的概述图 OPLS-DA 图表简述 [1]. OPLS-DA的得分图 OPLS-DA 得分图的横坐标表示OSC过程中的主要成分的得分值(Tp),所以从横坐标的方向可以看到组间的差异;纵坐标表示OSC过程中的正交成分的得分值(TO);...