OPLS-DA，即“正交偏最小二乘法判别分析”，是一种监督式机器学习方法。它利用两组分类信息作为Y变量进行建模，其中第一主成分（X轴）主要展示两组间的差异，而第二主成分（Y轴）则反映同组内的差异。这种方法能有效地揭示组间差异，因此在降维散点图中，两组分往往呈现明显的分离。然而，监督式分类模型的一个...
OPLS-DA不同于PCA,它是一种有监督的判别分析统计方法。运用偏最小二乘回归建立代谢物表达量与样本类别之间的关系模型,来实现对样本类别的预测 OPLS-DA需要样本变量矩阵和样本分类矩阵两个文件确立样本关系,如下所示: 图1 结果图1:OPLS-DA得分图: 横坐标表示OSC过程中的主要成分的得分值( Tp ) , 所以从横坐标...
ropls: PCA, PLS(-DA) and OPLS(-DA) for multivariate analysis and feature selection of omics data 理解OPLS-DA分析的原理和结果图 木舟笔记:R实战 | OPLS-DA(正交偏最小二乘判别分析)筛选差异变量(VIP)及其可视化
正交偏最小二乘判别分析（OPLS-DA）可以通过多种软件工具实现，这些工具包括但不限于：1. R语言：提供了`ropls`包来实现PCA、PLS(-DA)和OPLS(-DA)方法。该包包括R²和Q²质量指标、VIP值的计算，以及用于异常值检测的分数和正交距离等图形。2. SIMCA：SIMCA是一款专业的统计分析软件，用于多元数据分析，包...
本视频主要讲述关于GC-MS、电子鼻仪器的学术论文解读,并结合SIMCA如何做OPLS-DA分析(仅占视频的一小部分),以及讲述差异代谢物筛选、PCA、HCA、OAV、雷达图、指纹图谱等。,讲的不好的地方还请多多担待。, 视频播放量 59619、弹幕量 43、点赞数 1247、投硬币枚数 603、收
SIMCA14软件的使用(HCA、PCA、OPLS-DA分析), 视频播放量 2416、弹幕量 0、点赞数 14、投硬币枚数 6、收藏人数 25、转发人数 4, 视频作者 在学习的小鱼丸, 作者简介 中药学研二|复方神经药理方向欢迎私信交流,相关视频:SIMCA14软件的使用(2),SIMCA14的使用(3),机器
OPLS-DA：正交篇最小二乘法判别分析 原理：结果图1：OPLS-DA得分图：结果图2：OPLS-DA的S-plot图 结果图3：OPLS-DA的模型验证 permutation Test图
OPLS-DA分析是一种强大的多变量统计分析方法,主要用于分类和特征选择,尤其在代谢组学和组学数据分析中展现出极高的应用价值。 一、OPLS-DA的基本概念与原理 OPLS-DA,即正交偏最小二乘判别分析,是PLS-DA的改进版本,它结合了正交信号矫正技术,能够更有效地滤除与分类信息无关的噪声,从而提...
国际标准分类中,oplsda分析结果解读涉及到微生物学、肥料、环境保护、水质、辐射测量、煤、电学、磁学、电和磁的测量、电气工程综合、绝缘流体、变压器、电抗器、电感器、燃料、石油产品综合、粒度分析、筛分、实验室医学。 在中国标准分类中,oplsda分析结果解读涉及到肥料与土壤调理剂、化肥、化学土壤调理剂、土壤、肥...
不同于主成分分析( PCA)法,Partial Least Squares Discrimination Analysis,(PLS-DA)或 Orthogonal PLS-DA,(OPLS-DA)是一种有监督的判别分析统计方法。该方法运用PLS-DA建立代谢物表达量与样品类别之间的关系模型,来实现对样品类别的预测。分别建立两两分组比较的PLS-DA模型(图1)或OPLS-DA模型(图2),模型得到的...