1、使用opls包中的opls函数进行分析: #由于排序分析函数所需数据格式原因,需要对数据进行转置 otu <- t(otu_raw) ##opls-da分析——opls-da仅适用于二元分类,多元分类适用于pls-da分析 df1_oplsda <- opls(otu, group$group, predI = 1, orthoI = NA) 注:不指定或orthoI = 0时,执行PLS;orthoI =...
OPLS-DA分析 1、使用opls包中的opls函数进行分析: #由于排序分析函数所需数据格式原因,需要对数据进行转置 otu <- t(otu_raw) ##opls-da分析——opls-da仅适用于二元分类,多元分类适用于pls-da分析 df1_oplsda <- opls(otu, group$group, predI = 1, orthoI = NA) 注:不指定或orthoI = 0时,执行P...
多元分类适用于pls-da分析 df1_oplsda <- opls(otu, group$group, predI = 1, orthoI = NA)...
1、使用opls包中的opls函数进行分析: #由于排序分析函数所需数据格式原因,需要对数据进行转置otu<-t(otu_raw)##opls-da分析——opls-da仅适用于二元分类,多元分类适用于pls-da分析df1_oplsda<-opls(otu,group$group,predI=1,orthoI=NA) 注:不指定或orthoI = 0时,执行PLS;orthoI = NA时,执行OPLS 得到...