这将自动下载并安装OpenBabel的Python绑定。 验证安装 安装完成后,可以通过在Python交互式环境中输入以下代码来验证安装: import openbabel print(openbabel.__version__) 如果没有报错且输出版本号,则说明安装成功。 二、通过Anaconda安装 Anaconda是一个用于科学计算的Python发行版,集成了许多科学计算库和工具。使用Ana...
OpenBabel官方支持Python 2和Python 3，你需要根据你所使用的Python版本来安装相应的OpenBabel库。如果你...
基于Python的OpenBabel 2.4.1实战(1) 基于OpenBabel2.4.1的Python绑定开发,我自己绑定的Python版本为Python2.7. openbabel2.4手手册和pybel和openbabel库的使用。 下面是手册中的一个例子,练手!importopenbabel,pybelmol=openbabel.OBMol()a=mo… 阅读全文 ...
【摘要】 基于OpenBabel2.4.1的Python绑定开发,我自己绑定的Python版本为Python2.7. openbabel2.4手手册和pybel和openbabel库的使用。 下面是手册中的一个例子,练手! import openbabel, pybel mol = openbabel.OBMol()a = mol.NewAtom()a.SetAtomicNu... 基于OpenBabel2.4.1的Python绑定开发,我自己绑定的Pytho...
基于OpenBabel2.4.1的Python绑定开发,我自己绑定的Python版本为Python2.7. openbabel2.4手手册和pybel和openbabel库的使用。 下面是手册中的一个例子,练手! import openbabel, pybelmol = openbabel.OBMol()a = mol.NewAtom()a.SetAtomicNum(6) # carbon atoma.SetVector(0.0, 1.0, 2.0) # coordinatesb =...
python setup.py build_ext -I/path/to/openbabel-3.1.1/install/include -L/path/to/openbabel-3.1.1/install/lib python setup.py install --prefix=/path/to/python/libs/install 1. 2. 主要是需要指定一下刚才安装的 openbabel 3.1.1 的位置,install 时,如果不需要指定安装位置,会自动安装在 python ...
Open Babel是一款开源自由软件，能够进行化学结构文件格式的相互转换，通过C++编写并提供C++、Perl、Python等多种API接口，方便开发使用。为了在CentOS 7下编译安装Open Babel 2.4.1并绑定Python，首先需下载Open Babel 2.4.1的安装包，通过下载地址进行下载。其次，安装boost库，这是Open Babel运行所需的...
python import openbabel print(openbabel.__version__) 使用预编译的.whl文件安装 确保已安装Python和pip。 从可信源下载与你的Python版本和操作系统兼容的.whl文件。 导航到.whl文件所在目录,并使用pip安装: bash pip install openbabel-x.x.x-cpxx-cpxx-platform.whl 验证安装: python import openbabel as...
终端中输入 python （对于Mac和Linux系统会本身自带一个较低的Python版本） mac系统的安装Python的...
3.编写Python脚本实现xyz和sdf格式之间的转化 虽然可以在命令行中直接使用Openbabel,比如在命令行中将xyz转化为sdf: obabel tmp.xyz -ixyz -osdf -O tmp.sdf 命令非常简明易懂,但是笔者写的绝大部分脚本都是python的脚本,因此笔者更喜欢编写一个能进行xyz和sdf格式转化的python脚本【当然,在python可以用os.system...