omicsgene - 生物信息 实名认证 专业认证 性别: 北京- 北京市 注册于 2018-04-20 擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS生物信息关注 向TA求助 发私信 14114金币数 79650 经验值 435个粉丝 主页被访问 82072 次 TA的主页 TA的回答 TA的提问 TA的文章 TA的课程 TA的金币 TA的经验 TA的粉丝 716 篇文章 ...
「获FDA批准」,目前仅有以下三个泛癌panel获得FDA批准,没错,都是国外的。 Roche FoundationOne CDx 324基因(2017年获批) MSK MSK-IMPACT 468基因(2017年获批) NantHealth Omics Core 19,396基因(基于WES,包含MSK-IMPACT 468基因,严格讲不算panel。2019年获批) 「国内无获批产品」,有世和425基因、吉因加1021基因...
前面写了不少编程和绘图相关的生信工具,从本篇开始将重心转移到「Bioinformatics专业知识」上来,毕竟工具都是为专业服务的,工具再6不了解专业也是白搭。我将重点关注「WES、Gene Panel、RNA-seq、统计学、产前…
基于基因的数据库注释(「Gene-based annotation」),主要注释该SNV、CNV等变异所在的基因名称、是否影响编码蛋白及氨基酸位置信息,会用到RefSeq genes, UCSC genes, ENSEMBL genes, GENCODE genes, AceView genes等数据库; 基于基因组区域的数据库注释(「Region-based annotation」),主要注释该异位于基因组的什么功能区...
UMI(unique molecular identifer)是一种用来降低二代测序实验误差(sequencer, polymerase, DNA damage error and so on)的有效技术。建文库时在adapter处加入UMI,在生信分析时通过UMI区分真阳性突变和假阳性突变,提高检测的Sensitivity和Specificity,详细原理可以参考: 实验流程 其它步骤同上一篇,不同之处在于文库构建时添...
Email: info@bmkgene.com Tel : +859-227-1733 Address: 2 Davis Drive Suite 209 Durham NC 27709 ASIA Pacific Biomarker Technologies(Hongkong) Company Limited Email : info@bmkgene.com Tel: +852 22086076 Address: RM 06, 13A/F South Tower World Finance CTR Harbour City 17 Canton Rd, TST, KL...
Jakt, L. M,Nishikawa, S.DNA chip databases, omics, and gene fishing: commentary. Cancer Science . 2008Jakt LM, Nishikawa S. DNA chip databases, omics, and gene fishing: commentary. Cancer Sci. 2008;99(5):829–835. View this article via:...
常用组学工具 富集注释:gprofiler 富集注释:metascape 基因注释:Genecards 通路注释:KEGG 基因本体:GO Alphafold RoseTTAFold 常用资源 文献下载:免费共享 开源镜像:软件镜像源 论文爆料:pubpeer 关于我标签: Genecards 生物信息常用数据库分类 2019/9/2 添加评论 1.常用数据库 NCBI:美国国立生物技术信息中心综合数据库...
SeqMatic Adds Visium Spatial Gene Expression to its 10x Genomics Certified Service Provider Portfolio Featured Article February 1, 2023 SeqMatic: White-Glove Sequencing Expertise Aiding Genetic Research Premium White-Glove Service Operations Flexibility and Convenience - Skip the hassle of shipment or pack...
GiniClust: detecting rare cell types from single-cell gene expression data with Gini index High-throughput single-cell technologies have great potential to discover new cell types; however, it remains challenging to detect rare cell types that are distinct from a large population. We present a ...