从包括格拉瑞韦、格卡瑞韦和伏西瑞韦在内的第三代开始,PI药物的结构优化开始呈现出趋同性。例如,为了获得具备跨基因型效用和不受多种耐药突变影响的特性,它们均将二代PI中较常见的P1-P3大环改为了P2-P4大环,同时为了配合这一大环调整,它们的P2位置也统一为同一种基团。至此,能够无需联合干扰素、短疗程、低频...
另一方面,所有后续可逆HCV NS3/4A丝氨酸蛋白酶抑制剂均为P2–P4大环化合物。包括默克的伐尼瑞韦(vaniprevir,Vanihep,2014,仅在日本)、格拉瑞韦(grazoprevir,Zepatier,与NS5A抑制剂艾尔巴司韦联用,2016)和那拉瑞韦(narlaprevir,Arlansa,2016,仅在俄罗斯);Abbvie的格卡瑞韦(glecaprevir,Mavyret,与NS5A抑制剂哌...
These cetoamidas with cyclic P4 as NS3 serine protease inhibitors are useful in the treatment of hepatitis C virus (HCV)NJOROGE F. GEORGEGIRIJAVALLLABAHN VIYYOOR M.CHEN KEVIN X.NAIR LATHA G.VIBULBHAN BANCHAARASAPPAN ASHOKBENNETT FRANK...
Additionally substitutions with Gln, Glu, or Asp of peptide residue Leu-6 at position P4 were generated. However, unfortunately none of those assayed peptides showed any inhibitory effect. We interpret this result as an indication that the original peptides are already highly accommodated and that...
为了探索底物/抑制剂与NS3蛋白酶S1-S4口袋的结合,本文展示了ZIKV NS2B-NS3蛋白酶与三种拟肽抑制剂复合物的晶体结构。总的来说,底物或者抑制剂的加入并不会显著的影响NS3蛋白酶的构象变化。在这三种化合物中,抑制剂3对bZiPro具有最强的抑制力。其P4的4-胍基甲基-苯乙酰基基团起了重要的作用。
The results revealed that the P1 and P2 positions are most important for inhibitor binding, whilst the P3 and P4 positions have much less effect. These findings indicate that the characteristics of YFV protease are very similar to those reported for dengue and West Nile virus proteases, and ...
这些P4和P3氢键的相互作用使P4和P3侧链在HCV NS3/NS4a丝氨酸蛋白酶结合部位中的定位最佳化。另外,P2螺环脯氨酸基团填充P2袋,产生有利于与HCV NS3/NS4a丝氨酸蛋白酶中的Arg-155侧链相接触的范德瓦尔斯力。本发明还提供W基团,其可有效地结合于位于P1袋中的HCV NS3/NS4a丝氨酸蛋白酶的催化部位。
应用反转录及套式PCR 技术, 从陕西省西安市两位非甲～戊型急性肝炎患者的血清中提取RNA,经特异性的反转录引物P4反转录成cDNA ,以此为模板分别用P3,P4及P1,P2两对引物进行PCR扩增,扩增到218bp(4248nt～4465nt )的HGV RNA NS3区部分基因,将其克隆人PinPointTMXal-T载体,挑选阳性克隆并进行了序列分析,结果表明...
为了探索底物/抑制剂与NS3蛋白酶S1-S4口袋的结合,本文展示了ZIKV NS2B-NS3蛋白酶与三种拟肽抑制剂复合物的晶体结构。总的来说,底物或者抑制剂的加入并不会显著的影响NS3蛋白酶的构象变化。在这三种化合物中,抑制剂3对bZiPro具有最强的抑制力。其P4的4-胍基甲基-苯乙酰基基团起了重要的作用。
Besides, the P3, P1′, P2′ and P4′ subsites showed a less contribution in binding interaction (<−2 kcal mol−1). The catalytic water was detected nearby the carbonyl oxygen of the P1 reacting center of the capsid, intNS3, 2A/2B and 4B/5 peptides. These results led to the ...