在R语言中,创建nomogram图通常使用rms包。rms包提供了nomogram函数,用于构建nomogram图,以及plot函数,用于绘制该图。 plot函数在绘制nomogram图时的作用 plot函数在绘制nomogram图时,负责将nomogram函数生成的图形对象进行可视化展示。它允许用户调整图形的外观,如线条粗细、刻度标记、标签等,以更好地传达数据和信息。
# 可视化 Nomogram plot(nom, xfrac = 0.6) # 校准曲线cal <- calibrate(fit, method = "boot", B = 1000) # 1000 次 Bootstrap 校准 plot(cal, xlab = "Predicted Probability", ylab = "Observed Probability") 接下来小编基于logistic回归分析构建Nomogram列线图的方法,预测结直肠癌患的生存概率,使用...
model <- lrm(status ~ age + meno + nodes, data = gbsg[,-1]) nomogram <- nomogram(model, fun = function(x)1/(1+exp(-x))) # 逻辑回归计算公式 # 绘制列线图 plot(nomogram) 我们以第一行数据为例: > head(gbsg,1) pid age meno size grade nodes pgr er hormon rfstime status 1...
nom3 <- regplot(F2, plots = c("violin", "boxes"), ##连续性变量形状,可选"no plot" "density" "boxes" "ecdf" "bars" "boxplot" "violin" "bean" "spikes";分类变量的形状,可选"no plot" "boxes" "bars" "spikes" observation = train[2,]...
nomogram <- nomogram(model, fun = function(x)1/(1+exp(-x))) # 逻辑回归计算公式# 绘制列线图plot(nomogram) 四、结果解读 为了方便解释和演示过程,我们把列线图的自变量减少几个,我们以age,meno和nodes为自变量生成列线图。 model <- lrm(status ~ age + meno + nodes, data = gbsg[,-1])nomo...
#构建生存概率函数nom <- nomogram(f_cph, fun = list(function(x) surv(365, x), function(x) surv(365*3, x), function(x) surv(365*5, x)), funlabel = c("1-year Survival Probability", "3-year Survival Probabilit...
plot(cal5, lwd = 2,#error bar的粗细 lty = 2,#error bar的类型,可以是0-6 errbar.col = c("#2166AC"),#error bar的颜色 xlim = c(0,1),ylim= c(0,1), xlab = "Nomogram-prediced OS (%)",ylab = "Observed OS (%)",
nom<-nomogram(f2,fun=function(x)med(lp=x),funlabel="Median Survival Time")plot(nom) 简单介绍下使用,比如某患者年龄为50岁,那就在列线图年龄为50岁的地方向上画一条垂直线,即可得到其对应的得分(Points);男性,则在男性的地方画一条垂直线,以此类推,找出每个变量状态下对应的得分,相加得到总得分。
plt.plot(x,np.exp(x)) #y=e^x 指数函数 数学函数也可以用pandas库绘制,可详见我的另一篇博客:文章链接 #极坐标图 t=np.linspace(0,2*math.pi) x=3*np.sin(t); y=5*np.cos(t) plt.plot(x,y); plt.text(0,0,r'$\frac{x^2}{3^2}+\frac{y^2}{5^2}=1$',fontsize=20) #python...
plot(Nom.Surv,xfrac=.25,col.grid=gray(c(0.8,0.95))) ##主要是将前面Nomogram函数的结果画出来,一些参数可以起到美化作用 #lplabel:线性预测器横轴的名称,默认"Linear Predictor"。不过这个变量我一般会在Nomogram中关掉不显示; #fun.side:预测轴上的刻度值位置,1用于定位在轴下方(默认值),3用于轴上方。预...