regplot(coxfit, plots = c("violin", "boxes"), ##连续性变量形状,可选"no plot" "density" "boxes" "ecdf" "bars" "boxplot" "violin" "bean" "spikes";分类变量的形状,可选"no plot" "boxes" "bars" "spikes" observation = lung[1,], #用哪行观测,或者T F center = T, # 对齐变量 s...
nomogram <- nomogram(model, fun = function(x)1/(1+exp(-x))) # 逻辑回归计算公式# 绘制列线图plot(nomogram) 四、结果解读 为了方便解释和演示过程,我们把列线图的自变量减少几个,我们以age,meno和nodes为自变量生成列线图。 model <- lrm(status ~ age + meno + nodes, data = gbsg[,-1])nomo...
nomogram <- regplot(model,plots=c('violin','boxes'),observation=gbsg[2,-1],center=T,subticks=T,droplines=T,title='nomogram',points=T,odds=T,showP=T,rank='sd',interval='confidence',clickable=F) plot(nomogram) 六、总结 在本文中,我们介绍了列线图的基本概念、绘制方法和应用场景。列线图...
nom2 <- nomogram(f,fun=list(function(x)surv(1, x), function(x) surv(2, x), function(x) surv(3, x)),lp=F,funlabel=c('1-year survival','2-year survival','3-year survival'),maxscale=100,fun.at=c(0.99,0.9,0.8,0.7,0.6,0.5,0.4,0.3,0.2,0.1,0.05)) #构建Nomogram图plot(nom2...
plot(nom) 有朋友问到Cox回归的代码怎么写。Cox回归模型会复杂一些,因为可能涉及到不同时间点(3年、5年)生存概率的计算。下面讨论最简单的概率轴为中位生存时间的情况。 require(rms) require(Hmisc) ##需要下载安装 require(survival) ##R默认自带的用于做生存分析的包 ...
colplot(F2,coloroptions=3, risklabel="risk of Y", filename="nom") 3. 动态nomogram 3.1 nomoreg包点击图 Nomoreg包虽然具备一定点击功能,但是点起来也很难受。个人感觉体验差,而且图形也不够简洁美观。最后输出依旧是静态图,pubmed文献少。 范文SCI ...
plot(X,C) plot(X,S) show() 1. 2. 3. 4. 5. 6. X 是一个 numpy 数组,包含了从 −π到 +π等间隔的 256 个值。C 和 S 则分别是这 256 个值对应的余弦和正弦函数值组成的numpy 数组。另外,Matplotlib 的默认配置都允许用户自定义。你可以调整大多数的默认配置:图片大小和分辨率(dpi)、线宽、...
森林图forest plot senlin.jpeg 森林图的内容包括: 无效线:一条垂直于X轴,通常坐标X=1或0 每个研究:平行于X轴的线段,黑点为每个研究的效应量点估计值;方块面积代表研究权重;线段长度为研究效应量的95%可信区间 箭头:该研究效应量的95%可信区间超出图形显示范围 菱形:综合各个研究的汇总结果,中心为汇总效应量的点...
plot(nomo) 3.4 提取公式 nomogramEx(nomo=nomo,np=2,digit=9) hdnom包 hdnom包功能非常强大,我们以后再介绍它的具体用法吧,今天就只介绍一下绘制列先图的函数咯。😎. 4.1 示例数据 data("smart") x <- as.matrix(smart[, -c(1, 2)]) time <- smart$TEVENT ...
plot(nom) logisitc回归模型nomogram COX比例风险模型 f2 <- psm(Surv(time,status) ~ age+sex, data = lung, dist='lognormal') med <- Quantile(f2)# 计算中位生存时间 surv <- Survival(f2)# 构建生存概率函数 ## 绘制COX回归中位生...