植物NLR基因是一种抗病基因,也被称为抗病基因类似物。它是植物免疫系统中的关键执行者,负责感知与监控病原微生物的入侵。一旦监测到病原物,NLR免疫受体就迅速启动高效的抗病反应进而杀灭病原物。 NLR基因在植物中广泛存在,并且不同植物中的NLR基因数量有着数量级的差异。例如,拟南芥基因组中编码了149个NLR基因,而水稻...
核苷酸结合富含亮氨酸重复序列(NLR)蛋白是植物细胞内重要的免疫受体,负责检测入侵病原体并启动防御反应。虽然先前对NLR基因的进化和功能的研究主要限于陆生植物,但藻类中NLR基因的进化轨迹和免疫激活特性尚未充分探索。本研究对44个绿藻类物种和7个丝藻类物种进行了全基因组NLR基因分析。在五个绿藻和三个丝藻类物种中...
在探索和挖掘 NLR 基因的过程中,研究人员借助 NLRtracker 进行高通量搜索,随后还手动整理分析结果,确保准确性。他们运用系统发育分析,基于 PRG 数据库的 NBARC 结构域构建进化树,以探究 NLR 基因的分类和演化关系。此外,通过构建基因密度图和共线性图,来研究 NLR 基因在基因组中的分布和排列特征。在进化分析方面,...
Resistify是一个用于快速且准确地注释植物中的NLRs(Nucleotide-binding domain Leucine-rich Repeat,核苷酸结合域富含亮氨酸重复序列)并提供准确结构分类的工具。NLRs是植物先天免疫系统的关键组成部分,具有显著的存在/缺失变异和序列多样性。Resistify的开发旨在克服现有NLR预测工具在准确性、速度和可用性方面的限制。 Github...
近日,南京农业大学植物保护学院陶小荣教授团队在国际权威学术期刊PNAS在线发表了题为《NLRs derepress MED10b and MED7 mediated repression of jasmonate-dependent transcription to activate immunity》的研究论文,该研究以番茄NLR免疫受体Sw-5b...
NLR-Annotator 是以基因组序列作为输入,直接预测基因组上可能的NLR基因位点,同时可以把位点上下游2kb(具体长度可以自己定义)序列提取出来。然后把提取出来的序列去做基因从头注释,如果能够注释到基因就认为是NLR基因 之前一直没有搞明白注释到的基因位置是相对于提取出来的片段上的,怎么再把序列映射回基因组序列上,获得...
NLR蛋白基因家族包含了一系列的信号传导分子,能够感知细菌、病毒和其他病原体的存在,并激活免疫反应。这些蛋白通过结合其他蛋白或配体,发挥其功能。 NLR蛋白基因可以被分为三个不同的亚家族:NOD样受体(NOD-like receptors)、NACHT-LRR蛋白(NACHT-leucine-rich repeat proteins)和PYHIN蛋白(PYD-HIN200 domain-containing...
图1 NLR基因在藻类和陆地植物代表性物种中的分布情况 在此基础上,该研究在本氏烟中瞬时表达多个绿藻NLR基因,通过DAB染色、离子电导率测定、q-PCR等分子生物学实验,证实了绿藻TNL和RNL蛋白能够在烟草中激活类似陆地植物NLR蛋白的超敏反应(hypersensitive response, HR),并且绿藻TNL蛋白在烟草中激活HR反应也依赖于EDS1...
综上所述,化学诱变、R基因外显子捕获和测序三步走策略可用于快速克隆R基因,为小麦秆锈病的抗病育种提供了优良的基因克隆资源。该方法扩展性强,可以应用于大多数作物或它们的野生近亲,并且这一策略有望使作物具有更持久的抗病能力。此外,NLR Captur...
本文以大豆为研究对象,重点研究编码zf-RVT结构域的五个非典型NLR基因的功能。 二、材料与方法 1.材料 本研究选取了具有重要经济价值的大豆品种作为研究对象,并从其基因组中筛选出编码zf-RVT结构域的五个非典型NLR基因。 2.方法 (1)生物信息学分析:利用生物信息学软件对所选基因进行序列分析、结构预测和功能注释...