Nipye的安装主要有三种方式: 1.1Docker 如果想要在Windows系统上使用Nipype,恐怕除了虚拟机意外,最简单便捷的方式就是使用Docker了,在使用Docker时,只需要从镜像库将其拖下来就好了,需要执行如下命令: docker pull nipype/nipype 至于拖下来之后怎么用,目前我还没有研究,等有机会的看一下。 1.2 Conda Conda的安装也...
1. 安装 需要说明的是,截止目前为止,Nipype在类Unix系统上会运行的更稳定一些,例如Linux、MacOS都是完美支持的,对于Windows则不完全支持(虽然能够通过Conda和Pip安装上,但是运行的时候会报错,似乎其中引用了一个getpwd的包,而这个包只支持Linux等系统)。 Nipye的安装主要有三种方式: 1.1 Docker 如果想要在Windows系统...
1. 安装 需要说明的是,截止目前为止,Nipype在类Unix系统上会运行的更稳定一些,例如Linux、MacOS都是完美支持的,对于Windows则不完全支持(虽然能够通过Conda和Pip安装上,但是运行的时候会报错,似乎其中引用了一个getpwd的包,而这个包只支持Linux等系统)。 Nipye的安装主要有三种方式: 1.1 Docker 如果想要在Windows系统...
所有需要使用的工具需要事先装好,且环境变量配置正确。 非要在Windows下使用的话还是考虑一下Docker吧(感觉不如虚拟机……简单……) 2. Concepts Interface 如图所示,Interface可以简单理解为将各软件包函数进行封装后暴露在Python中的接口,也就是将各种不同形式、不同平台的函数抽象为了一组类似的方法(大概学过OOP...
pnlbwh/pnlNipype master 5Branches6Tags Code README License Developed by Tashrif Billah, Sylvain Bouix, and Yogesh Rathi, Brigham and Women's Hospital (Harvard Medical School). This pipeline is also available as Docker and Singularity containers. Seepnlpipe-containersfor details....
Last commit message Last commit date Latest commit Cannot retrieve latest commit at this time. History 15,079 Commits .circleci .github doc docker examples nipype tools .codespellrc .coveragerc .dockerignore .et .git-blame-ignore-revs .gitattributes ...
docker pull nipype/nipype 至于拖下来之后怎么用,目前我还没有研究,等有机会的看一下。 1.2 Conda Conda的安装也非常简单,只需要执行如下命令就可以了,当然为了便于演示和操作,建议也安装Jupyter。(我用的就是这种方法) conda install --channel conda-forge nipype ...
在docker官方教程里说windows系统运行linux容器时,可以在settings-file sharing里 添加需要访问的文件夹。 win10用docker容器运行本地python文件 https://blog.csdn.net/qq_41100991/article/details/98769530 docker run-vI:/38chongqing/38chongqing_MRI/BIDSstructure:/home/data-w/home/data nipype/nipype ...
docker Pin grabbit 0.1.2 for now Jun 16, 2018 examples after comments from Chris Feb 23, 2018 nipype MAINT: Bump dev version Sep 25, 2018 tools Merge remote-tracking branch 'upstream/master' into rel/1.0.4 May 25, 2018 .coveragerc ...
This pipeline is also available as Docker and Singularity containers. Seepnlpipe-containersfor details. Table of Contents Citation If this pipeline is useful in your research, please cite as below: Billah, Tashrif*; Eckbo, Ryan*; Bouix, Sylvain; Norton, Isaiah; Processing pipeline for anatomical...