② load_nii 以及 save_nii 必须成对使用; ③ 若使用make_nii,则后续应当用 save_nii 保存图像。 个人推断,图像显示软件主要通过头文件识别该图像是否经过仿射变换,所以务必保证file.img与file.hdr方向一致。
我使用一个特定的工具箱()来使用MATLAB处理NIfTI文件,但是当我做一个简单的值修改时,与图像相关的空间信息会发生某种改变。我不能直接比较前后的图像,因为它们有不同的起源和/或一些轻微的翻译。我没有(有意)修改NIfTI头信息。original.nii');save_nii(mat 浏览3提问于2016-05-17得票数 0 回答已采纳 ...
nib.save(niiNew,'data_new.nii') 写入需要一个affine矩阵,我一般都会事先读入一个nii文件,然后用它的affine属性去创建新的nifti。然后用nib.save()将内存中的nifti写入磁盘。 2.3 替换特定值 importnibabelasnib nii = nib.load('data.nii') data = nii.get_fdata()print(data.shape)# 将矩阵中所有非零...
适用于matlab读取.nii格式的文件 脑部MR图像处理。 NIfTI这个Matlab程序可以读取显示、保存、制作核磁共振图像。 具体如下: >> [hdr,filetype,fileprefix,machine] = load_nii_hdr('output.hdr'); >> [img,hdr] = load_nii_img(hdr,filetype,fileprefix,machine); >> save_nii(nii, filename, [old_RGB]...
适用于matlab读取.nii格式的文件 脑部MR图像处理。 NIfTI这个Matlab程序可以读取显示、保存、制作核磁共振图像。 具体如下: >> [hdr,filetype,fileprefix,machine] = load_nii_hdr('output.hdr'); >> [img,hdr] = load_nii_img(hdr,filetype,fileprefix,machine); >> save_nii(nii, filename, [old_RGB]...
dicm2nii Convert DICOM into NIfTI. It can also convert PAR/XML/REC, HEAD/BRIK, MGZ and BrainVoyager files into NIfTI. nii_tool Create, load, save NIfTI file. Support both version 1 and 2 NIfTI, and variety of data type. nii_viewer ...
import SimpleITK as sitk itk_img = sitk.ReadImage('./nifti.nii.gz') img = sitk.GetArrayFromImage(itk_img) print("img shape:",img.shape) ## save out = sitk.GetImageFromArray(img) # # out.SetSpacing(itk_img.GetSpacing()) # # out.SetOrigin(itk_img.GetOrigin()) sitk.WriteImage(...
对场景进行高分辨率的高保真渲染是计算机视觉和图形学领域的一个长期目标。实现这一目标的主要范式是精心...
%插值reslice,就用reslice_nii这个函数就可以了 %比如要采样到1mm就用reslice_nii('orginal.nii','new.nii',[1 1 1]); clc root = ['G:\ResearchData\DCE90_NiiDATA','\']; save_root = ['G:\ResearchData\DCE_ResliceNiiDATA','\']; ...
Command line usage is described in theNITRC wiki. The minimal command line call would bedcm2niix /path/to/dicom/folder. However, you may want to invoke additional options, for example the calldcm2niix -z y -f %p_%t_%s -o /path/output /path/to/dicom/folderwill save data as gzip ...