基于小鼠和人体组织切片,研究人员证明了Array-seq能够基于较大表面积的载玻片产生具有高检测灵敏度和定位特异性的高通量空间转录组信息。总之,通过结合经典的DNA微阵列和NGS技术,该团队创建了一个简单灵活的平台,可用于从小到大样本的大规模空间分子生物学研究。 打开网易新闻 查看精彩图片 文章发表在Nature Methods 主...
我们的病毒基因组测序分析工作流程可用于Sanger和NGS数据,还包括对使用ARTIC网络协议生成的PCR扩增片段的全面支持。我们简化了这个有时很复杂的过程,以便您可以更快地进入分析阶段。首先在 SeqManUltra 中组装病毒基因组测序数据,以评估变异并为每个样本生成共有序列,然后在MegAlignPro 中快速将大组基因组与已知菌株进行比...
NGS分析手把手教学系列继WGS全基因组分析以后终于更新啦。这次是RNA-seq转录组分析。本文主要是指导操作流程,不会浪费篇幅在解释RNA-seq原理上。 本章会使用人类基因组,比较组间的差异基因。其他物种的数据同样适用。 所有代码都亲测可用(2023年4月),由于一些老旧版本的工具以及网络协议已经没法使用,所以也会有最新版...
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综上所述,该研究将微阵列与NGS技术相结合,开发了一种简单有效的空间转录组学分析方法Array-seq,其能够突破空间分析界限,处理从小到大的样本,例如,从小鼠组织到整个人体器官等。同时,Array-seq还可以通过处理来自同一组织的大量连续切片来实现组织样本的三维分析。值得注意的是,Array-seq具有较大表面积、成本低且具有...