nei氏遗传距离公式 公式的数学原理基础。 向量空间角度理解。 可以将两个种群的等位基因频率向量→x=(x_1,x_2,·s,x_n)和→y=(y_1,y_2,·s,y_n)看作是n维向量空间中的两个向量。 公式中∑_i = 1^nx_iy_i实际上就是向量→x和→y的内积,表示两个向量在方向上的相似程度,内积越大,说明两个...
关于用Nei氏标准遗传距离推算 畜禽分化时闻的探讨 整主 (西北农业太学畜牧系,陕西抒艟,71210O) {7-', 58f3?f 应用N~i氏标准遗传距离推算畜离在若干年前的分化时间与考古学的研究结果 及人们的一般认 识极不相同,本文从密码子的平均替换率,电泳昕测的基因位点数目,人为因素对 ...
21 0014) //‘哆f 摘要 以实际基因频率为基础,用计算机模拟和实例分析等方法研究了Nei氏标准遗传距离 估测精度的影响因素。指出:(1)稀有等位基因和在品种间低变异度的基因对聚类分析贡献极小,实 验设计中可不予考虑;(2)相似品种间具有较低的遗传距离期望值,此时遗传距离的估测精度较低, 实验设计中应多考虑...
以实际基因频率为基础,用计算机模拟和实例分析等方法研究了Nei我标准遗传距离估测精度的影响因素.指出:(1)稀有等位基因和在品种间低变异度的基因对聚类分析贡献极小,实验设计中可不予考虑;(2)相似品种间具有较低的遗传距离期望值,此时遗传距离的估测精度较低,实验设计中应鑫闰点数和个体数;(3)位点数较少时遗传距...
首先需要Nei-li遗传距离的矩阵,用GenAlEx可以做GenAlEx分析微卫星位点的等位基因数(Na)、有效等位基因数(N e)、Shannon’s信息指数(I)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、计算群体间的Nei’s遗传距离 - 知乎 (zhihu.com) 就是这个 然后在mega中 按他需要的格式写好,官方手册Input Data and Formats --MEGA...
满意答案 Nei是指通过计算遗传距来分析遗传多样性的,即通过计算单倍型多样性指数来计算群体间的核苷酸序列歧化距离,是根据种群间不同基因所占的比例算出的遗传多样性,并不是用哪个算出来的,如果想做最后的遗传聚类图,可以用viewtree画出! 00分享举报您可能感兴趣的内容广告 2023办公软件教程大全文档下载,即下即用,...
结论是，为了构建微卫星进化树聚类树，首先需要通过GenAlEx计算Nei-li遗传距离的矩阵，关注等位基因数（Na）、有效等位基因数（N e）、Shannon’s信息指数（I）、观测杂合度（Ho）和期望杂合度（He）等遗传学指标。接着，这些数据需要按照MEGA软件的特定格式进行整理，参考官方手册中的Input Data and ...
构建SSR微卫星进化树聚类树，首先需要计算Nei-li遗传距离。使用GenAlEx工具，可以进行微卫星位点等位基因数(Na)、有效等位基因数(N e)、Shannon’s信息指数(I)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)的分析，最终得到群体间的Nei’s遗传距离。接着，需要将数据按照MEGA软件所需格式进行整理，并保存为.mega...
Nei 氏标准遗传距离的估测精度 张继全;邵春荣;王毓英;陈幼春 【期刊名称】《畜牧兽医学报》 【年(卷),期】1998(000)001 【摘要】无 【总页数】1页(P27) 【作者】张继全;邵春荣;王毓英;陈幼春 【作者单位】无 【正文语种】中文 【相关文献】 1.关于用Nei氏标准遗传距离推算畜禽分化时间的探讨 [J], ...
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