VlnPlot(pbmc, features = c("nFeature_RNA","nCount_RNA")) 过滤前 nFeature_RNA图:反映的是样品中每个细胞表达的基因数量,表达过高可能是双细胞或者多细胞,表达过低可能是空液滴或者包裹的是环境RNA nCount_RNA图:反映的是每个细胞中包含的UMI数量也就是转录本的数量 在10X Genomics测序数据分析过程中,通过U...
#nCount_RNA:总的UMI数即转录本数量colSums(sce@assays$RNA$counts)#nFeature_RNA:总的基因数目colSums(sce@assays$RNA$counts>0) 可视化及阈值判断 可以使用小提琴图来简单可视化一下nFeature_RNA和nCount_RNA 代码语言:javascript 复制 VlnPlot(pbmc,features=c("nFeature_RNA","nCount_RNA")) 过滤前 nFeatu...
VlnPlot(pbmc, features = c("nFeature_RNA","nCount_RNA")) 过滤前 nFeature_RNA图:反映的是样品中每个细胞表达的基因数量,表达过高可能是双细胞或者多细胞,表达过低可能是空液滴或者包裹的是环境RNA nCount_RNA图:反映的是每个细胞中包含的UMI数量也就是转录本的数量 在10X Genomics测序数据分析过程中,通过U...
VlnPlot(pbmc, features = c("nFeature_RNA", "nCount_RNA")) 过滤前 nFeature_RNA图:反映的是样品中每个细胞表达的基因数量,表达过高可能是双细胞或者多细胞,表达过低可能是空液滴或者包裹的是环境RNA nCount_RNA图:反映的是每个细胞中包含的UMI数量也就是转录本的数量 在10X Genomics测序数据分析过程中,通过...
nFeature_RNA图:反映的是样品中每个细胞表达的基因数量,表达过高可能是双细胞或者多细胞,表达过低可能是空液滴或者包裹的是环境RNA nCount_RNA图:反映的是每个细胞中包含的UMI数量也就是转录本的数量 在10X Genomics测序数据分析过程中,通过UMI对测序得到的reads进行简并之后,就可以看到一个细胞中被读到多少个基因。