申请Bioproject&Biosample登录号;2、将原始数据上传至SRA数据库(ncbi中专门收录原始数据的数据库)。
SRA Lite是NCBI里对SRA文件的另一个格式(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/docs/sra-data-formats/) 我们平常下载的SRA文件属于SRA Normalized Format,它和SRA Lite之间最大的区别就是SRA Lite采用了简化的quality scores,具体它是如何简化的请参考原文 SRA Lite files are produced from SRA Normalized Format ...
可能是他们检查你传的文件得到的md5码跟你表格里填的对不上。要不就是你表格填错了，要不就是传文件...
提交metagenome数据到NCBI的SRA，state显示hup, hup代表什么意思？
1. 一般传到SRA的数据都是去接头的 clean data，方便共享给其他科研人员。 但是也有一些科研人员，乱传...
可能是他们检查你传的文件得到的md5码跟你表格里填的对不上。要不就是你表格填错了，要不就是传文件...
传的是fastq还是bam，你表格里面有没有写md5？检查下md5。
有fastq文件损坏了，估计你断点续传了好几次，文件损坏了，fix一下，然后把坏的样品重传一下就行 ...