遇到这种情况要先点击“Delete”删除上传的文件,根据表格中的提示,重新修改后再上传。 4.6进入SRA metadata界面 与上一步骤类似,先下载表格,填写数据的信息。 SRA metadata表格如下, 该表格分为三个sheet,第一和第三的sheet是一些补充说明。需要填写的是第二个sheet。这里要注意:“sample_name”要与上一步表
03.申请SRA编号和数据上传 1.回到最初的提交页面 2.开始申请SRA编号,操作如下:进入SRA 点击新的提交 填写提交者信息与之前填写信息一致 填写BioProject编号,回到提交页面 进入BioProject查看编号 复制编号后回到提交页面 进入SRA未完成的位置 将编号填写进去并选择释放日期,需与之前填写的释放日期一致 3.编号填写和释放...
3 上传SRA数据 进入:Sequence Read Archive (SRA)然后new submission,需要注意第二步添加BioProject 上传对应的样本信息,下面excel表有示例,最后如果一个样品有多个文件,就在后面添加相关信息。 BioProject唯一,BioSample根据注册信息填写,每行一个 最后一行为示例,上传不存在该信息 上传数据,这一步用代码会比较快一些,...
选择文件:上传→可能会出现错误,按提示修改就可以了 6.SRA Metadata SRA元数据 Upload a file using Excel or text format→Download Excel ★表格填完后要将第二个工作簿单独保存为TSV格式,可以将数据复制到txt中,保存再修改文件拓展名。 许多列都给出了可选项,可以直接选择,platform,instrument-model等可以从结题...
要开始数据上传，首先确保你已注册并登录SRA账号。整个过程分为8个步骤，包括填写提交者信息、问卷调查、项目信息、样本类型选择和详细属性填写等。遇到问题时，可以直接通过邮件sra@ncbi.nlm.nih.gov与后台团队联系，他们的处理速度很快且友好。在上传过程中，如遇到问题，切记保存未完成的任务，稍后可以从...
通常情况下,在GSA中完成一个数据递交需要执行五个操作,分别为注册项目、样本、实验、测序四类元数据信息和提交序列文件(图3)。在元数据信息收集页面,GSA系统提供友好访问的页面向导帮助用户实现信息录入;而针对测序文件上传,GSA提供基于IPV4和IPV6两条网络链路的FTP服务器,...
原始数据极速上传NCBISRA教程选择合乎口味的物品加入购物车tsv文件可用excel打开每列表格都有固定格式特别是organism列切记准确填写如果爆出warn信息则需要等待2个工作日方能重新进行该步骤别问小美为什么知道说多都是泪然后付款选择文件上传当然他们只收rmb只支持tsv或者txt格式文件上传 原始数据极速上传NCBISRA教程 之前为...
第六次上传 这次不同的情况: 数据不在Server上,在我们电脑远程连接的storage里,所以需要在Mac上操作 主要是整理数据,样品名+fq1+fq2 然后建立softlinks 最后就是准备那两个Excel表了,sample表+SRA数据表 其他:Mac的ascp命令在它的application包里,需要花点心思去找,命令跟Linux是通用的 ...
4. Raw data上传: 收到Biosample编号后，登录并选择SRA，填写个人信息和通用信息。填写项目摘要和library_ID，下载或在线填写上传表格，确保文件名规范。5. 上传数据: 安装Aspera Connect进行大数据传输，选择文件上传，确认信息无误后提交。等待NCBI审核，通常2天内会收到确认邮件和登录号。百易汇能生物...