GenBank :全球最大的公共DNA序列数据库 ,存储数百万物种的基因数据。 dbSNP :人类和其他生物的单核苷酸多态性(SNP)数据库 。 ClinVar :记录基因变异与疾病关联的临床数据库。 Protein(蛋白质数据库) :存储蛋白质序列和结构数据(与PDB合作)。 2. 数据分析工具 BLAST :最常用的...
1.DNA测序 1.DNA一次测序的长度为500bp。2.基因组的测序方案：将大的染色体打断成100kbp的片断，插入到BAC(BacterialArtificialChromosome)中。再随机打断，克隆，然后再组装成长的序列(contig)。3.EST(Expressedsequencetag)测序：细胞中mRNA反转录成cDNA，方向不定，测序。4.UniGene:为每一个基因创造一个唯一的条目...
比对之后,BLAST会按照评分高低、序列相似度对结果进行排序,另外BLAST还可以对小鼠数据库以及其它基因组数据库进行比对。 蛋白质序列的默认数据库包括GenBank非冗余数据库、RefSeq、Swiss-Prot、PDB、PIR和PRF等。此外,还包括这些数据库下的子数据库以及其它一些专利数据库和...
(PDB)三维结构的一部分,排除了那些理论模型。MMDB 重新组织和验证了这些 信息,从而保证在化学和大分子三维结构之间的交叉参考。数据的说明书包括生 物多聚体的空间结构,这个分子在化学上是如何组织的,以及联系两者的一套指 ...
29、27271 None nucleic acid 150Database Name nDescriptionProaramAll GenBank+EMBL+DDBJ+PDB sequences (but no E5T, STS, GSS.environmental samples or phase o, 1 or 2 htgs sequences) BLASTN 2.2.25+ >CitationDtstributKm of 8$ Blast Hrts on the Query Sequence *Mouse-over to show define ...
(150 letters) Query ID Description Molecule type Query Lenath ld|27271 None nucleic acid 150 Database Name n「 Description Proaram All GenBank+EMBL+DDBJ+PDB sequences (but no E5T, STS, 35、GSS.environmental samples or phase o, 1 or 2 htgs sequences) BLASTN 2.2.25+ >Citation Dts...
NCBI在线blast数据库的简要说明Peptide Seque nee Databases 蛋白序列的数据库 nrAll non-redu ndant Ge nBank CDS tran slati ons +RefSeqProte ins + PDB + S 6、wissProt +PIR + PRF所有非冗余的的Gen Ba nk CDSx的翻译序列+参考序列的蛋白+ PDB数据库+ SwissProt 蛋白数据库+ PRF蛋白数据库refseq...
・ 来自 PDB 和分子模型数据库(M olecularM odeling Database,MMDB) 的蛋白质三维结构数据。・ PubM ed通 过 Entrez 系统, 用户 可以 获得整合的 信息。 例如,Entrez 蛋白质数据库与分类学数据库交互链接, 使研究人员能够发现找到分类学信息——即发现该蛋白质序列的物种。一个序列可以与发表这个序列的...
附2: NCBI在线blast数据库的简要说明 本文详细出处参考: HYPERLINK /475/ /475/ Peptide Sequence Databases蛋白序列的数据库 nr All non-redundant GenBank CDS translations + RefSeq Proteins + PDB + SwissProt + PIR + PRF 所有非冗余的的GenBank CDS区的翻译序列 + 参考序列的蛋白 + PDB数据库 + ...
1 NCBI分子生物学数据库http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 美国国立医学图书馆（NLM）于1988年11月4日建立国家生物技术信息中心（NationalCenterofBiotechnologyInformation,简称NCBI）。2013-8-7ZhejiangUniversity,PreventiveVet.Med.,DrWeihuanFANG2 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Database/index.html 2013-8-7 Zheji...