研究人员可以通过GEO查询特定基因的表达情况,进行差异表达分析,甚至可以下载数据进行自定义分析。 此外,NCBI还提供了Genome Data Viewer(GDV),这是一个可视化工具,可以帮助用户查看基因组结构、注释和变异信息。用户可以选择特定的物种和染色体,查看相关的基因和功能区域,这对于基因组研究和功能基因组学非常有用。 掌握这...
HomoloGene、ProtEST、dbMHC、dbSNP、dbVar、Epigenomics、the Genetic Testing Registry、Genome和相关工具、比对查看器、跟踪存档、Sequence Read Archive、BioProject、BioSample、ClinVar、MedGen、HIV-1/人类蛋白质相互作用数据库、Gene Expression Omnibus
^欧洲分子生物学实验室(European Molecular Biology Laboratory) ^日本DNA数据库(DNA Data Bank of Japan) ^International Nucleotide Sequence Database Collaboration ^The Single Nucleotide Polymorphism Database ^"Var" means variation. ^"GaP" means genotypes and phenotypes. ^also known as whole genome associat...
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Genome BLAST 该工具将核苷酸或蛋白质序列与基因组序列数据库进行比较,并使用基本局部比对搜索工具(BLAST)算法计算匹配的统计显着性。 Genome Data Viewer (GDV) 用于真核RefSeq基因组装配的交互式导航的基因组浏览器,其具有对基因,表达,变异和其他注释的全面检查。 Genome Decoration Page 一种可帮助生成关于基因组组...
GRC致力于纠正错误代表的位点并完善剩余的装配间隙。 此外,GRC寻求为复杂或结构变异的基因组位点提供替代组装。 在GRC网站(http://www.genomereference.org)上,公众可以查看目前正在审查的基因组区域,报告基因组相关问题并联系GRC。 HIV-1, Human Protein Interaction Database ...
我们开发了一款全基因组比较可视化工具——the Comparative Genome Viewer (CGV) (https://ncbi.nlm.nih.gov/genome/cgv/) 。CGV能够利用NCBI数据库中已有的基因组序列进行物种内和物种间的比对,并以可视化的方式展示比对结果,比对算法由NCBI及其他合作者联合开发。研究人员能够检测跨染色体的大型结构变异,例如染色体倒...
NCBI中的genome data viewer （GDV）怎么用来查看启动子，mRNA等信息，还请各位大神不吝赐教~楼主会用了...
NCBI中的genome data viewer （GDV）怎么用来查看启动子，mRNA等信息，还请各位大神不吝赐教~楼主会用了...
NCBI's flagship genome browser, Genome Data Viewer (GDV), displays our in-house RefSeq annotation; is integrated with other NCBI resources such as Gene, dbGaP, and BLAST; and provides a platform for customized analysis and visualization. Here, we describe how members of the biomedical research ...