Pathways from PubChem:来自美国国立卫生研究院的公共化学数据库,该部分主要提供目的基因参与的信号通路的相关信息,可用于分析和解释分子机制。 Interactions:收录蛋白相互作用的相关信息,均附有对应参考文献。 General gene information:包含同源性、基因本体论、基因型、基因探针等内容。 General protein information:提供该...
Pathways from PubChem:来自美国国立卫生研究院的公共化学数据库,该部分主要提供目的基因参与的信号通路的相关信息,可用于分析和解释分子机制。 Interactions:收录蛋白相互作用的相关信息,均附有对应参考文献。 General gene information:包含同源性、基因本体论、基因型、基因探针等内容。 General protein information:提供该...
基因数据库收录全部已测序物种的基因注释信息，包括基因的命称、染色体定位、基因序列和编码产物（mRNA、蛋白质）情况、基因功能和相关文献信息等，并与GenBank、OMIM、遗传多态数据库（如dbSNP、dbVar）等NCBI子库，及KEGG、Gene Ontology等外源性数据库进行交叉引用。基因数据库是目前最权威的基因注解数据库。Gene数据...
基因参考功能数据库(GenRIF 数据库),是关于基因功能的简短说明。GeneRIF 提供了一种简单的机制,允许科学家添加基因数据库中描述的基因的功能注释。每个 GeneRIF 都有一个指向科学出版物的 PubMed ID 的指针,该出版物为 GeneRIF 的声明提供证据。 OMIM 在线孟德尔遗传人类数据库(OMIM),是一个不断更新的人类基因和...
NCBI收录全世界所有实验室测序过的核酸信息,包括宏大的“人类基因组计划”测序结果、小鼠等所有物种的测序信息。此外,NCBI还提供许多功能强大的数据检索与分析工具(Analyze模块)。 2.NCBI数据库核酸序列检索、查看与下载 找到nucleotide(若是找基因或基因组可以选择gene,genome,此外...
目前NCBI是查询基因信息最常用的数据库之一,本期就来详细介绍下具体的使用方法。以人TP53为例,首先打开1的下拉列表,选择“gene”,输入TP53查询,查询页面如下图所示,可通过基因名称、ID、全称、种属以及别称来进一步确认。 点击基因名称进入详情界面,最上方显示目的基因名称、种属、ID和信息最新更新日期,下方则是详细信...
生物医学文献数据库(PubMed):收录了全球的生物医学文献信息,用户可以通过关键词搜索相关文献。 蛋白质数据库(Protein):收录了全球的蛋白质序列信息,用户可以通过搜索蛋白质的名称或序列获取相关信息。 基因数据库(Gene):收录了全球的基因信息,包括基因的名称、位置、功能等信息。
目前NCBI是查询基因信息最常用的数据库之一,本期就来详细介绍下具体的使用方法。以人TP53为例,首先打开1的下拉列表,选择“gene”,输入TP53查询,查询页面如下图所示,可通过基因名称、ID、全称、种属以及别称来进一步确认。 点击基因名称进入详情界面,最上方显示目的基因名称、种属、ID和信息最新更新日期,下方则是详细信...
NCBI拥有多个数据库,主要包括GenBank、PubMed、BLAST、Protein、Nucleotide、Gene、OMIM、GEO等。每个数据库的功能都各具特色,共同为生物医学研究提供了强大的支持和数据资源。 GenBank数据库是一个庞大的公共遗传序列数据库,用户可以搜索、下载和分析各类生物的遗传序列数据。例如,科研人员可以在这里查找某个物种的基因序...
用户可以在CCDS的网页上使用基因名或序列ID进行搜索,还可以链接到Entrez Gene数据库、历史记录信息、转录体和蛋白质序列、Map Viewer、Ensemble Genome Browser、UCSCGenome Browser和桑格研究院的Vega Browser。用户可以到ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/CCDS/下载CCDS序列数据。