Database of Genotypes and Phenotypes (dbGaP) 储存基因型和表型相互作用研究结果和描述的数据库,这些研究包括全基因组关联(GWAS)、医学重测序、分子诊断,以及基因型与非临床性状之间的关联。 Database of Short Genetic Variations (dbSNP) 数据库包含单核苷酸突变、微卫星和小规模插入和缺失信息。 GenBank NIH基因序...
dbSNP数据库还收录确认信息、种群特异性等位基因频率信息(population-specific allele frequencies)和个体基因型信息。所有这些信息都可以在dbSNP数据库的FTP站点中找到。 7.3 供常规临床应用的数据库 7.3.1 dbMHC dbMHC数据库是有关主要组织相容性复合体(MHC)的数据库。它收录了各种MHC等位基因的变异信息,这些信息与...
SNP Single Nucleotide Polymorphism Database (dbSNP) 是單鹼基核苷酸取代以及短臂刪除和插入多形性的集中 Repository 資料庫。* Structure Structure 資料庫又稱為 Molecular Modeling Database (MMDB),包含結晶和 NMR 結構測定的實驗資料。MMDB 的資料取自 Protein Data Bank (PDB)。NCBI 已將結構資料交叉連結至書...
HomoloGene的结果报告包括基因同源性和来自OMIM、小鼠基因组信息学(Mouse Genome Informatics, MGI)、斑马鱼信息网络(Zebrafish Information Network, ZFIN)、酵母基因组数据库(Saccharomyces Genome Database, SGD)、直系同源基因簇(Clusters of Orthologous Groups,COG)和果蝇...
1.3 NCBI dbSNP 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP) 主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上。dbSNP(The Single Nucleotide Polymorphism database) 是一个公共的核酸多态性的数据库,它是关于单碱基替换以及短插...
RT 如何将新发现的SNP上传到NCBI dbSNP database 我在NCBI官网上看到http://www.ncbi.nlm.nih.gov/...
RT 如何将新发现的SNP上传到NCBI dbSNP database 我在NCBI官网上看到http://www.ncbi.nlm.nih.gov/...
Use of molecular variation in the NCBI dbSNP database. Hum Mutat 15:68 -75.Sherry ST , Ward M , Sirotkin K . 2000 . Use of molecular variation in the NCBI dbSNP database . Hum Mutat 15 : 68 – 75 .Sherry, S.T. et al. (2000) Use of molecular variation in the NCBI dbSNP ...
4.遗传多态数据库NCBI中的dbSNP、dbVar、dbGaP和ClinVar四个子库涉及DNA多态或变异信息。其中，dbSNP收录了所有物种中发现的短序列多态和突变信息，包括单核苷酸多态（single nucleotide polymorphysm，SNP）、微卫星（microsatelite）、小片段插入/删除多态（in/del）等定位、侧翼序列和功能、频率信息，收录的SNP条目一般...
dbSNP (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp) The database of single nucleotide polymorphisms (SNPs) and multiple small-scale variations that include insertions/deletions, microsatellites, and non-polymorphic variants. === directory layout .├── specs # dbSNP...