•dbEST-表达序列标签数据库,短的.单次(测序)阅读的cDNA序列。也包括来自干差异显示和RACE实验的cDNA序列。 •dbGSS-基因组调查序列的数拯库.短的、单次(测序)阅读的cDM序列.exon trap获得的序列.cosmid/BAC/YAC末端.及其他 & •dbSTS-序列标签位点的数抵库,短的在基因组上叫以被唯一操作的序列,用于产...
dbSTS是NCBI一种新的数据库,主要收录基因标志序列或序列标志位点和图谱数据。虽然dbSTS序列将并入GenBank,但是dbSTS中的注释更具综合性,包括有关实验者、实验条件和基因图谱定位等更为详细的信息。 dbSTS检索方法和步骤与dbEST相同。 五、文本检索(Text Searching) NCBI提供文本检索服务。可通过两种形式进行检索,一种...
DbEST — 表达序列标签数据库—短的(300—500bp)的cDNA序列,代表mRNA的单次(测序)阅读。常常有大量的EST被测序,并代表了在一个给定的组织或一个给定的发育阶段的基因表达的快照。同时包含了由CGAP计划产生的ESTs,和来自差异显示及RACE实验的序列。 克隆 克隆登记 — 由多方人类基因组测序中心使用的数据库,用来记...
dbEST, dbGSS, dbSTS搜索叶面 —EST, GSS, 和STS序列可以从两种方法获得:GenBank(通过Entrez)的EST/GSS/STS部分,和分开的但相关的数据库dbEST/dbGSS/dbSTS。两种来源的序列和accession number是一致的,但是纪录的格式不一样,dbEST/dbGSS/dbSTS纪录包括了一些基于BLAST搜索结果增加的注解,包括上至15最佳匹配的核酸...
(3) mIT SNP数据库():该网站是由美国麻省理工学院建立的。它包括数千条已经定位的SNP,可以通过指定染色体的某一区域查询SNP。 牛牛文库文档分享其它的其它的SNP站点还有:站点还有:华盛顿大学,网址是:,网址是:美国人类基因组研究所,网址是: nHGRI/Der/variat.htm。 牛牛文库文档分享牛牛文库文档分享dbEST: GenBank...
dbEST—表达序列标签数据库,短的、单次(测序)阅读的cDNA序列。也包括来自于差异显示和RACE实验的cDNA序列。 dbGSS—基因组调查序列的数据库,短的、单次(测序)阅读的cDNA序列,exon trap获得的序列,cosmid/BAC/YAC末端,及其他。 dbSTS—序列标签位点的数据库,短的在基因组上可以被唯一操作的序列,用于产生作图位点。
·dbEST-表达序列标签数据库,短的、单次(测序)阅读的cDNA序列。也包括来自于差异显示和RACE实验的cDNA序列。 ·dbGSS-基因组调查序列的数据库,短的、单次(测序)阅读的cDNA序列,exon trap获得的序列,cosmid/BAC/YAC末端,及其他。 ·dbSTS-序列标签位点的数据库,短的在基因组上可以被唯一操作的序列,用于产生作图...
·dbEST-表达序列标签数据库,短的、单次(测序)阅读的cDNA序列。也包括来自于差异显示和RACE实验 的cDNA序列。 ·dbGSS-基因组调查序列的数据库,短的、单次(测序)阅读的cDNA序列,exontrap获得的序列, cosmid/BAC/YAC末端,及其他。 ·dbSTS-序列标签位点的数据库,短的在基因组上可以被唯一操作的序列,用于产生作图...
2. Ensembl数据库:基因组注释。 3. ESTs数据库; 4. UniGene数据 3、库 5. Refseq数据库; 6. NCBI的Gene信息数据库; 7. 蛋白质序列:Swissprot/TrEMBL/UniProt数据库。,三大数据库之间的联系,GenBank中测序最多的20个物种,161.0版,2007.08,dbEST: 表达序列标签数据库,2007.08,总序列45,660,524条,最多的20...
dbEST — 表达序列标签数据库,短的、单次(测序)阅读的cDNA序列。也包括来自于差异显示和RACE实验的cDNA序列。 dbGSS —基因组调查序列的数据库,短的、单次(测序)阅读的cDNA序列,exon trap获得的序列,cosmid/BAC/YAC末端,及其他。 dbSTS —序列标签位点的数据库,短的在基因组上可以被唯一操作的序列,用于产生作图...