COBALT是一个蛋白的多序列比对工具,其实用法跟ClustalW是很像的。算法应该是不一样的。在我看来,COBALT是应该更加精确的。因为COBALT在多序列比对的同时,也用到RPS-BLAST, BLASTP, 和PHI-BLAST等工具,并且也用到了conserved domain database (CDD) 和PROSITE protein-motif database来保证COBALT比对结果的质量。最后...
COBALT COBALT是一种蛋白质多序列比对工具,使用RPS-BLAST,BLASTP和PHI-BLAST找到从保守结构域数据库,蛋白质基序数据库和序列相似性衍生的成对约束的集合。 Cn3D 用于从NCBI的Entrez检索服务查看三维结构的独立应用程序。 Coffee Break 作为NCBI Bookshelf的一部分,Coffee Break结合了近期生物医学发现的报告和NCBI工具的...
COBALT是一种蛋白质多序列比对工具，使用RPS-BLAST，BLASTP和PHI-BLAST找到从保守结构域数据库，蛋白质基序数据库和序列相似性衍生的成对约束的集合。
使用COBALT(Constraint Based Protein Multiple Alignment Tool)来比对多条蛋白质序列。 MOLE-BLAST 用于对多个查询序列进行分类并发现它们之间的关系。 07 参考资料: BLAST TOPICS (nih.gov) HowTo_BLASTGuide.pdf (nih.gov) BLAST QuickStart - Comparative Genomics - NCBI Bookshelf (nih.gov) HowTo_NewBLAST.p...
NCBI(National Center for Biotechnology Information,美国国家生物技术信息中心)除了维护GenBank核酸序列数据库外,还提供数据分析和检索资源。NCBI资源包括Entrez、Entrez编程组件、MyNCBI、PubMed、PudMed Central、PubReader、Gene、the NCBI Taxonomy Browser、BLAST、Pimer-Blast、COBALT、RefSeq、UniGene、HomoloGene、ProtEST...
NCBI(National Center for Biotechnology Information,美国国家生物技术信息中心)除了维护GenBank核酸序列数据库外,还提供数据分析和检索资源。NCBI资源包括Entrez、Entrez编程组件、MyNCBI、PubMed、PudMed Central、PubReader、Gene、the NCBI Taxonomy Browser、BLAST、Pimer-Blast、COBALT、RefSeq、UniGene、HomoloGene、ProtEST...
COBALT COBALT是一种蛋白质多序列比对工具,使用RPS-BLAST,BLASTP和PHI-BLAST找到从保守结构域数据库,蛋白质基序数据库和序列相似性衍生的成对约束的集合。 Cn3D 用于从NCBI的Entrez检索服务查看三维结构的独立应用程序。 Coffee Break 作为NCBI Bookshelf的一部分,Coffee Break结合了近期生物医学发现的报告和NCBI工具的...
例如,COBALT(Constraint-Based Multiple Alignment Tool)可以用于多序列比对,Open Reading Frame Finder可以用于预测DNA序列中的开放阅读框,而RefSeq database则提供了高质量的基因组和蛋白质序列等。 综上所述,NCBI是一个强大的生物学数据库和工具资源,对于生物学研究者和生物信息学家来说非常重要。通过NCBI,可以查找...
NCBI数据库提供了多种生物学分析和检索工具,如BLAST、COBALT、Cn3D等。这些工具可以帮助研究者进行基因序列比对、蛋白质结构分析、基因功能预测等任务,极大地提高了研究效率。 四、提供生物信息学教育资源 NCBI数据库还提供了生物信息学教育资源,包括教程、案例研究、练习题等。这些资源可以帮助学生和研究者更好地理解和...
NCBI工具_Primer-BLAST——NCBI的引物设计和特异性检验工具 Primer-BLAST：NCBI的引物设计和特异性检验工具∷柳城.Name 引物（Primers）如果你已经设计好了引物，要拿来验证引物的好坏。可以在Primer Parameters区填入你的一条或一对引物。并且选择好验证的目标数据库（在specificity check区选择）。根据需要可设置产物的...