点击BLAST运行,等待,,, 检索结果显示 检索结果解读(重点看5、8、9三个指标) Description:如果结果中出现过多hypothetical protein假设蛋白、Unnamed protein product未命名蛋白、Putative uncharacterized protein(未表征蛋白)等结果,表明进行比对的数据库不太合适,检索结果意义不大。 Scientific Name :学名 Common Name :...
BLAST将一个查询序列与一个目标数据库中的序列进行比对,并输出比对结果。下面将介绍如何看懂NCBI BLAST输出结果。 BLAST报告的不同部分提供了关于比对结果的详细信息。以下是BLAST输出结果中的重要部分: 1.查询信息: 在输出结果的第一部分,会显示关于查询序列的信息,如查询序列的名称、长度以及描述。这些信息可以帮助...
NCBI BLAST输出结果提供了在数据库中找到的最相关的序列匹配结果,以及其他有关这些匹配结果的统计信息。为了更好地理解NCBI BLAST输出结果,需要了解输出结果的基本结构、匹配结果的意义以及其他可能对研究有帮助的信息。 NCBIBLAST的输出结果通常分为四个主要部分:1.查询标题和信息;2.对于每个匹配,给出的序列标识、匹配...
BLASTP 是蛋白序列到蛋白库中的一种查询; BLASTX 是核酸序列到蛋白库中的一种查; BLASTN 是核酸序列到核酸库中的一种查询; TBLASTN 是蛋白序列到核酸库中的一种查询。与 BLASTX 相反,它是将库中的核酸序列翻译成蛋白序列,再同所查序列作蛋白与蛋白的比对。 TBLASTX 是核酸序列到核酸库中的一种查询。此种查...
在比对设置页面,填写两条比对的序列,然后点击“blast”进行比对。 注意: 1.建议复制的序列使用Fasta格式,就是 第一行是: >名称 2.上面的空格填写参考序列,下面的空格填写待验证的序列; 备注:务必将参考序列(其为完整序列)作为Query,否则会影响结果的可读性。
如何看懂NCBI BLAST输出结果 解读报告前需要掌握的概念 alignments 代表比对上的两个序列 hits 表示两个序列比对上的片段 Score 比对得分,如果序列匹配上得分,不一样,减分,分值越高,两个序列相似性越高 E Value 值越小,越可信,相对的一个统计值。 Length 输入序列的长度...
length输入序列的长度identities一致性就是两个序列有多少是一样的query代表输入序列sbjct代表数据库中的序列结果详细说明菜单与基本信息ncbiblast结果菜单与基本信息1下一步操作的菜单你可以调整参数重新比对保存你的搜索条件以便下次比对调整报告显示的参数以更符合你的要求下载你比对的结果 如何看懂NCBI BLAST输出结果 2010...
BLAST是一种基于序列比对的方法,可用于确定一给定序列与数据库中序列的相似性。其工作原理是将查询序列与数据库中的序列进行比对,并生成一个比对得分来衡量它们之间的相似程度。通过BLAST的结果,可以获得序列的匹配位置、长度、相似性等信息,从而帮助研究人员进行更深入的生物学研究。 二、使用方法 1.打开NCBI网站 首先...
可以通过点击"Export"按钮导出结果。四、基因序列比对结果解读BLAST结果页面会显示待比对序列与数据库中序列的比对结果，包括最佳比对结果的位置、相似度、E值等信息。可以通过对比对结果的分析，了解待比对序列的同源性、进化关系等信息。五、注意事项1. 选择合适的比对数据库：根据待比对序列的类型（DNA或Protein）和...