BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是由NCBI(National Center for Biotechnology Information)开发的基于局部比对算法的一组搜索工具。BLAST包含有NCBI的很多数据库。 BLAST主要包括BLASTn,BLASTp,BLASTx,tBLASTn 和tBLASTx。 官网:BLAST: Basic Local Alignment Search Tool (nih.gov) 主界面显示如下:(tBLASTx通过...
一、BLAST界面 网址:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/ 二、Blastp检索 1.基本检索 1.1 enter query sequence(输入查询序列) query subrange(序列范围):默认全部 1.2 choose search set (选择搜索数据库) 一般选择nr/nt数据库 organism:选择物种 1.3 program selection(筛选程序选择) 2. algorithm parameter (算法...
BLAST是“局部相似性基本查询工具”(Basic Local Alignment Search Tool)的缩写。是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发的一个基于序列相似性的数据库搜索程序。该程序将DNA/蛋白质序列与公开数据库所有序列进行匹配比对,从而找到相似序列。 生物序列的相似性相似性(similarity):是指一种很直接的数量关系,比如部分相同...
NCBI BLAST的功能和种类 1. 引言 NCBI BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是一种常用的基于序列相似性进行比对的算法。通过在数据库中搜索相似序列,BLAST能够识别和注释序列的功能、结构和进化信息。本文将介绍NCBI BLAST的功能和种类,并深入探讨其在生物信息学和基因组学研究中的应用。 2. BLAST的基本原理 ...
其中,BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是一种常用的序列比对工具,可用于在数据库中搜索相似序列。 一、BLAST简介 BLAST是一种基于序列比对的方法,可用于确定一给定序列与数据库中序列的相似性。其工作原理是将查询序列与数据库中的序列进行比对,并生成一个比对得分来衡量它们之间的相似程度。通过BLAST的结果,...
BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是由NCBI(National Center for Biotechnology Information)开发的基于局部比对算法的一组搜索工具。BLAST包含有NCBI的很多数据库。 BLAST主要包括BLASTn,BLASTp,BLASTx,tBLASTn 和tBLASTx。 官网:BLAST: Basic Local Alignment...
其中,BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是一种经典的序列比对工具,用于比对和分析DNA、RNA和蛋白质序列的相似性。 使用NCBI中的BLAST可以有多种方式,包括在线使用和本地使用。下面将对这两种使用方式进行详细介绍。 一、在线使用NCBIBLAST NCBI提供了一个在线的BLAST界面,用户可以直接在浏览器中使用。具体步骤...
NCBI在线BLAST使用方法与结果详解 BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较(de)分析工具.BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较.BLAST结果中(de)得分是对一种对相似性(de)统计说明. BLAST采用一种局部(de)算法获得两个序列中具有相似性(de)序列. Blast中常用...
NCBI BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是一种用于比较和识别核酸或蛋白质序列之间相似性的生物信息学工具。它由美国国家生物技术信息中心(NCBI)开发,广泛应用于生物科学研究中。 功能: BLAST的主要功能是在大型数据库中搜索与查询序列相似的序列。它可以快速找出与查询序列具有一定相似度的已知序列,从而帮助研究...