use the flag multiple times. Global Flags --api-key string Specify an NCBI API key --debug Emit debugging info --filename string Specify a custom file name for the downloaded
访问NCBI网站 首先,打开浏览器并访问NCBI的官方网站:[NCBI主页](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)。 ## 2. 搜索目标基因 在NCBI主页的搜索框中输入目标基因的名称或基因ID,例如“P53”或“TP53”。然后点击“Search”按钮进行搜索。 ## 3. 选择目标基因 搜索结果会显示与查询相关的多个条目,包括文献、基因、...
设定Expect值调到0.001降低假阳性，选择Megablast模式加快速度。当比对结果出现多个相似片段，勾选“Align two sequences”进行两两比对，用“Show color key”功能标出保守区域。特别注意低复杂度区域可能干扰结果，勾选“Mask for lookup table”过滤简单重复序列。下载结果时存成XML格式方便后续用Biopython解析，文本...
同样需要注意的是,直到2012年2月, Entrez EFetch API默认的返回格式为纯文本格式文件,现在默认的为XML格式。 作为另外的选择,你也可以使用rettype="fasta"来获取Fasta格式的文件;参见EFetch Sequences 帮助页面。 记住,可选的数据格式决定于你要下载的数据库——请参见EFetch 帮助页面. 如果你要获取记录的格式是Bio...
#怎么获取API key 首先需要一个NCBI账号 登陆账号,进入setting页面找到API Key Management即可创建一个API Key. API key 例子: 示例:假设您获取一个密钥“ABCD123”。下面是一个简单的EInfo请求: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/einfo.fcgi?db=pubmed&api_key=ABCD123 ...
全选后，点击metadata就可以直接下载这个数据集各个数据的详细的内容。页面上也会有一个PRJNA381058，类似...