打开NCBI BLAST → 勾选 Align two or more sequences → 上方输入框 粘贴注释序列 → 下方align输入框 键入多个想比对序列 # align只会弹出一个输入框 → 复制序列时带上名称 即可多序列同时比对多个序列 √如 “>U10099.1:694-1326 Human POM-ZP3 mRNA, complete cds” Nucleotide BLAST: Align two or mo...
01、下载蛋白序列,输入数据进行Blast 从NCBI下载ALK的完整蛋白序列,并在Align two(or more) sequences using BLAST (bl2seq)界面按照如下设置: 1.由于是人类的蛋白序列比对小鼠cDNA序列,所以比对方式选择tblastn:Search translated nucleotide database using a protein query。 2.将对应的人类蛋白序列和小鼠核酸序列...
接着，登录NCBI首页，在页面右上角找到“popular resources”，点击第一个选项“blast”。进入后，选择“nucleotide blast”。在页面中会看到一个输入框，用于输入序列。如果要对比两个序列，需勾选下方的小单选框“Align two or more sequences”。此时，页面会显示两个输入框，分别输入小鼠和人类的p53...
首先，通过NCBI搜索目标基因，找到CDS部分，复制目标序列。接着，打开NCBI BLAST工具，勾选"Align two or more sequences"选项，将复制的注释序列粘贴到上方输入框，下方则输入需要比对的其他序列，记得每个序列名称后加上标识，如">U10099.1:694-1326 Human POM-ZP3 mRNA, complete cds"。点击开始比对...
左上的输入框可以读取任意核酸序列,包括Genbank的检索编号,ATCG和FASTA格式的一段序列,或者点击choose file上传一个FASTA格式的文件。点击复选框“Align two or more sequences”可以添加多个序列比对。Query subrange可以指定搜索的残基范围。 Blastn包括基础数据库nr(nonredundant nucleotide),Refseq(rna,gene,genomes等...
选择“Align two or more sequences”,分别输入ACCESSION号“BAC16799”和“NP_998989.3”; 最终可得到序列同源性比例即为“Per.Ident”值; 本期关于蛋白序列的比对方法就介绍到这里 后续大家还想了解关于什么数据库的使用 可以给我们留言哦 我们会持续更新!
1 利用百度搜索找到NCBI官方网站 2 在网站的右侧找到BLAST选项并点击进入 3 在Basic Blast内找到核酸blast并点击进入 4 在输入查询的对话框中打入目标序列， 勾选Align two or more sequences,可以输入两个以及三个以上的序列选项进行对比 5 把两段或者两段序列输入后，点击Blast进行比对，这时需要等几秒时间 6 ...
左上的输入框可以读取任意核酸序列,包括Genbank的检索编号,ATCG和FASTA格式的一段序列,或者点击choose file上传一个FASTA格式的文件。点击复选框“Align two or more sequences”可以添加多个序列比对。Query subrange可以指定搜索的残基范围。 Blastn包括基础数据库...
选择“Align two or more sequences”,分别输入ACCESSION号“BAC16799”和“NP_998989.3”; 最终可得到序列同源性比例即为“Per.Ident”值; 本期关于蛋白序列的比对方法就介绍到这里 后续大家还想了解关于什么数据库的使用 可以给我们留言哦 我们会持续更新!
5.找到Specialized BLAST,点击Aligntwo (or more) sequences using BLAST (bl2seq) 6.将序列1复制、黏贴到Enter Query Sequence框中。 7.将序列2复制、黏贴到Enter Subject Sequence框中。 8.在Program Selection下面,选择Highly similar sequences (megablast)(高度相似序列)或其他分析程序 9、点击BLAST按钮,进行...