01、下载蛋白序列,输入数据进行Blast 从NCBI下载ALK的完整蛋白序列,并在Align two(or more) sequences using BLAST (bl2seq)界面按照如下设置: 1.由于是人类的蛋白序列比对小鼠cDNA序列,所以比对方式选择tblastn:Search translated nucleotide database using a protein query。 2.将对应的人类蛋白序列和小鼠核酸序列...
打开NCBI BLAST 打开NCBI BLAST → 勾选 Align two or more sequences → 上方输入框 粘贴注释序列 → 下方align输入框 键入多个想比对序列 # align只会弹出一个输入框 → 复制序列时带上名称 即可多序列同时比对多个序列 √如 “>U10099.1:694-1326 Human POM-ZP3 mRNA, complete cds” Nucleotide BLAST: A...
左上的输入框可以读取任意核酸序列,包括Genbank的检索编号,ATCG和FASTA格式的一段序列,或者点击choose file上传一个FASTA格式的文件。点击复选框“Align two or more sequences”可以添加多个序列比对。Query subrange可以指定搜索的残基范围。 Blastn包括基础数据库nr(nonredundant nucleotide),Refseq(rna,gene,genomes等...
左上的输入框可以读取任意核酸序列,包括Genbank的检索编号,ATCG和FASTA格式的一段序列,或者点击choose file上传一个FASTA格式的文件。点击复选框“Align two or more sequences”可以添加多个序列比对。Query subrange可以指定搜索的残基范围。 Blastn包括基础数据库...
方法/步骤 1 利用百度搜索找到NCBI官方网站 2 在网站的右侧找到BLAST选项并点击进入 3 在Basic Blast内找到核酸blast并点击进入 4 在输入查询的对话框中打入目标序列, 勾选Align two or more sequences,可以输入两个以及三个以上的序列选项进行对比 5 把两段或者两段序列输入后,点击Blast进行比对,这时需要等几...
5.找到Specialized BLAST,点击Aligntwo (or more) sequences using BLAST (bl2seq) 6.将序列1复制、黏贴到Enter Query Sequence框中。 7.将序列2复制、黏贴到Enter Subject Sequence框中。 8.在Program Selection下面,选择Highly similar sequences (megablast)(高度相似序列)或其他分析程序 9、点击BLAST按钮,进行...
①点击上述网址,勾选“Align two or more sequences”: ②在“Enter Query Sequence”中输入金唯智M13F(-47)正向引物测序结果(正反向均可,NCBI比较智能,可以自行调整): ③在“Enter Subject Sequence”中输入Addgene下载的pUC19序列: ④ 继续下滑,“Program Selection”选择“Optimize for Highly similar sequences ...
打开经典BLAST,勾选 Align two or more sequences 此时出现了两个输入框 咱们回到之前EM的结果界面,把相似酶列表滑到最右边,每个酶的FASTA序列都在最右边标注出来了,只需要点一下序列,它就自动复制在粘贴板上了 太人性化了吧 随便选两个为例,复制序列,分别粘贴在BLAST的两个输入框中 ...
如果进行两两比对,或者多个序列的比对,在Enter Query Sequence框中选中Align two or more sequences,...
进到那个页面有个框就是让你输序列的,如果要比对两个序列的话,要勾选下面的一个小的单选框“Align two or more sequences ”。就会出现两个框,分别输入人和小鼠的序列。点最下面大大的“blast”按钮,就可以了。希望对你有帮助,欢迎追问~00分享举报