NCBI，全称为美国国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information），是一个在全球范围内广受认可的生物技术信息数据库。该数据库提供了广泛的生物信息资源，涵盖了基因、RNA、蛋白质序列等多个领域。与专注于基因组检索的Ensembl数据库相比，NCBI的数据库内容更为广泛和综合。NCBI提供了多达36种不同...
tblastx:只在特殊情况下使用,它将DNA被检索的序列和核酸序列数据库中的序列按不同的阅读框全部翻译成蛋白质序列,然后进行蛋白质序列比对。操作界面与blastn和blastp很相似,差别在于在Choose File下有Genetic Code的选项来选择翻译的密码子模板。 Blastx的余下部分就是Blastp的蛋白质数据库;tblastn则为Blastn的核酸数...
blastx:先将待查询的核酸序列按六种可读框架(逐个向前三个碱基和逐个向后三个碱基读码)翻译成蛋白质序列,然后将翻译结果对蛋白质序列数据库进行查询; tblastn:先将核酸序列数据库中的核酸序列按六种可读框架翻译成蛋白质序列,然后将待查询的蛋白质序列及其互补序列对其翻译结果进行查询; tblastx: 先将待查询的核酸序...
首先，从NCBI首页选择适合的BLAST类型，包括Nucleotide BLAST（核苷酸搜索），Protein BLAST（蛋白质搜索），blastx（核苷酸转录到蛋白质搜索），以及tblastn（蛋白质翻译成核苷酸搜索），依据您的研究需求来决定。接下来，输入查询序列。每个搜索页面都有输入框，格式可以是原始序列、FASTA格式、NCBI登录号、GenB...
只知道一个蛋白质的名字，怎么在NCBI上查它的序列，并翻译成三字母缩写的氨基酸序列 工具/原料 NCBI网站 SMS2查询网站 方法/步骤 1 1、复制蛋白名字并粘贴到NCBI上，National Center for Bioinformics Institution 2 2、选择确定要选的蛋白质，复制单字母序列 3 打开蛋白质序列分析软件：放在评论区自取，点击镜像此...
相较于blastp，blastn则专注于核酸序列的比对，它将你的核酸序列与核酸序列库中的数据进行匹配，这对于基因组学和转录组学研究至关重要。而tblastn和blastx则分别针对核糖核酸和翻译后的蛋白质进行反向搜索，为反向遗传学和蛋白质功能预测提供了关键支持。每一个blast工具都有其独特的应用领域，选择合适的...
Protein Sequence(蛋白质序列库):与核酸类似,也是从NCBI多个不同资源中编译整理的,方便研究者的直接查询。 Structure(结构)-——关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划,另外也可以访问三维蛋白质结构的分子模型数据库(MMDB)和用来搜索和显示结构的相关工具。MMDB:分子模型数据库—一个关于三维生物分子结构的数据...
5952 0 01:21 App snapgene 翻译DNA序列为氨基酸序列 5620 1 00:36 App 基因序列转氨基酸序列|DNAMAN 12.4万 115 13:15 App 【干货】如何使用NCBI寻找基因DNA、mRNA及蛋白质序列【瞎说的】 21.1万 52 06:03 App 基因进化树的构建和美化(中) 【多序列比对与MEGA构建进化树】 9685 1 00:27 App 氨基酸...
首先，Blast有多种类型，包括blastp（蛋白质对蛋白质），blastn（核酸对核酸），blastx（核酸翻译后对蛋白质），tblastn（蛋白质对核酸翻译），以及tblastx（两种核酸翻译后的蛋白质水平比对）。基本操作涉及选择合适的Blast类型，输入fasta格式序列或Accession number，指定比对数据库（如nr/nt）和物种，以及...