blastx:先将待查询的核酸序列按六种可读框架(逐个向前三个碱基和逐个向后三个碱基读码)翻译成蛋白质序列,然后将翻译结果对蛋白质序列数据库进行查询; tblastn:先将核酸序列数据库中的核酸序列按六种可读框架翻译成蛋白质序列,然后将待查询的蛋白质序列及其互补序列对其翻译结果进行查询; tblastx: 先将待查询的核酸序...
Protein BLAST是指在蛋白质数据库中搜索相似的蛋白质序列; blastx是将核苷酸翻译成蛋白质并在蛋白质数据库中进行搜索; tblastn是在核苷酸序列数据库中的翻译版本搜索蛋白质序列。 2 输入要查询的序列 每一个BLAST搜索页面都有一个输入框,您可以将您想要查询的序列按以下格式输入到这里:原始序列,FASTA格式,NCBI登录号...
NCBI 的ORF Finder http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html 怎么用NCBI查询FeSOD的蛋白质序列、氨基酸序列和核苷酸序... 一般进入NCBI界面,选择GENE,输入FeSOD,物种名,比如人,homo, 查询就可以导出,氨基酸序列也会跟着出来,如果没有,可以通过超链接查找,或者把GE... 皇御环球-正规贵金属交易平台,存取...
MS–MS 谱被绝配 NCBI 的天然蛋白质数据库使用 Pro ID (ABI) 软件。 翻译结果4复制译文编辑译文朗读译文返回顶部 MS-MS光谱是符合国立生物技术信息中心多态的NR蛋白质数据库使用临ID(ABI)软件。 翻译结果5复制译文编辑译文朗读译文返回顶部 MS-MS光谱与NCBI的NR蛋白质数据库匹配了使用赞成ID (ABI)软件。
是一个强大的在线工具,用于识别给定核苷酸序列中的开放阅读框(ORFs)。
NCBI 的ORF Finder http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html
右边可以选择输出文件的格式,以及从哪个链上寻找翻译框,在不知道蛋白编码方向的情况下,最好是全部选上。以水稻条纹病毒(RSV)的某个分离物的CP的基因序列为例(NCBI accession number:AY286101.1)。 当我们将序列粘贴到框里之后,点击translate按钮,就会得到如下输出: ...
最简单的是在ncbi 找到这个基因序列,点击它的蛋白id号,就出来氨基酸序列了。你也可以不用ncbi ,使用...
NCBI 的ORF Finder http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html