一、吐槽: 目前在开发宏基因组的项目,需要构建蛋白质子库,虽然网上有许多帖子,但我按照他们分享的流程操作发现最后达不成目的,于是自己去找官网的说明来操作。我觉得最难绷的一点是,我按照这些帖子说的,直…
打开NCBI官网“https://www.ncbi.nlm.nih.gov/”,“All Databases”选择“Protein”,对话框输入p53 human。 点击P53 [Homo sapiens]进入,ORIGIN信息即是人源p53蛋白的氨基酸序列信息; 若是序列信息太长,复制麻烦,可以直接选择ACCESSION号“BAC16799”(推荐使用); “All Databases”选择“Protein”,对话框输入p53 ...
UniProt 是 Universal Protein 的英文缩写,是信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库。它由整合Swiss-Prot、 TrEMBL 和 PIR-PSD 三大数据库的数据而成。他的数据主要来自于基因组测序项目完成后,后续获得的蛋白质序列。它同时包含了大量来自文献的蛋白质的生物功能的信息。网址:uniprot.org/1、打开网站,输入查找的基因...
NCBI数据库平台中,蛋白质类数据库包含以下哪些( )A.ProteinB.StructureC.dbVarD.Protein Clusters
直接点击exon或者CDS能在下方高亮显示出来,右下角也给出了翻译的蛋白质的序列。 从核苷酸数据库看到的蛋白质序列和我们点击“NP”开头的序列跳转到蛋白质数据库的结果是一样的。 5.只知道ID时搜索基因 有时,我们在阅读文献的时候没有发现基因的名称,只找到了这个基因在NCBI的ID号,这个时候我们直接在NCBI主页“All...
在NCBI数据库中,可以通过查询蛋白质的序列标识(如蛋白质的NCBI Accession号码)来获取该蛋白质的相关信息,包括二级结构信息。 获取蛋白质的二级结构信息可以通过以下步骤进行: 1. 在NCBI的主页(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)上的搜索栏中输入蛋白质的序列标识,点击搜索按钮进行搜索。 2. 在搜索结果页面中,找到...
益加医上传的教育视频:1.蛋白质数据库使用合集NCBI 数据库,粉丝数440,作品数641,免费在线观看,视频简介:1.蛋白质数据库使用合集NCBI 数据库
运用NCBI数据库查找目的蛋白序列或目的碱基序列 第1种方法 1.打开NCBI官网,并选择Gene菜单,如下图。 2.在搜索栏内输入想要查找的蛋白名称或基因名称,此处以基因RSK2为例,如图。 3.在搜索结果中查找目的蛋白,注意Description栏会标明物种信息,以human为例,Aliases栏会列出目的蛋白的各种别名。 4.在Searchresult页面中...
NCBI下载物种基因组的信息 1.打开NCBI主页:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/数据库选择gemome,输入物种拉丁名 Homo sapiens搜索: 搜索结果如下: 包括基因组的信息,gff信息,蛋白质信息等等都可以点击下载,如果基因组组装有多个版本可点击browse list,查看多个版本, ...
我看ncbi蛋白质好像可以搜到诸如swiss等等数据库的数据，那么它不可以搜到的或者没有和它共享的数据库有...