如果NCBI还没有收录到该物种的基因组信息,比如我输入芥菜拉丁名Brassica juncea,搜索结果就如下面这样。 现在我们以拟南芥为例,下载拟南芥的基因组信息,输入拉丁名搜索结果如下: 点击“Genome Assembly and Annotation report”就进入下面的这个界面: 因为拟南芥基因组已经研究得比较透彻了,NCBI上也收录了不同版本的基因...
ncbi中的基因组genome全序列下载 基因组的全系列下载最⽅便的就是通过NCIBI的ftp直接下载。ftp地址为:基因组资源ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genomes/ 包括⼈、⼩⿏、果蝇、线⾍等模式⽣物,以及微⽣物、植物等的基因组。各种⽂件的说明,FTP站点 (genomes ⽬录) — 下载各种格式的完整的染⾊体...
在NCBI上下载了全基因组序列,但是太大了,不能用记事本打开,怎么办呢?SSRhunter只识别记事本格式啊,...
从ncbi下载的全基因组序列压缩包是FNA格式 不能解压怎么办 通常下载基因搏隐陪基蠢组序列是fasta或者text格式,用电脑自带的笔记本携胡软件就能打开,没见过下载压缩包这么麻烦的。
我想从NCBI里面下载一个种菌株的全基因组fasta序列,虽然很多菌株都公布了基因组信息,但是没有公布fasta...
不用下全基因组序列,只把同源基因下下来,对比就行了 上ncbi主页 点进BLAST (Basic Local Alignment ...
不用下全基因组序列,只把同源基因下下来,对比就行了 上ncbi主页 点进BLAST (Basic Local Alignment ...
首先打开NCBI,在搜索框选择【Genome】,然后输入你要下载的物种拉丁名。如果NCBI还没有收录到该物种的基因组信息,比如我输入芥菜拉丁名Brassica juncea,搜索结果就如下面这样。 现在我们以拟南芥为例,下载拟南芥的基因组信息,输入拉丁名搜索结果如下: 点击“Genome Assembly and Annotation report”就进入下面的这个界面:...
红框表示两个版本上面的的版本是在下面版本的基础上更新的我们下载最新的版本点击tair10终于迚入下载界面了在界面的右侧红框所示的地方即是下载链接注意哈genbankftpsite不refseqftpsite都可以下载物种的全基因组信息但是genbankftpsite会提供rna蛋白的一个gff格式文件而refseq上没有gff 首先打开NCBI,在搜索框选择【...
在NCBI上下载了全基因组序列,但是太大了,不能用记事本打开,怎么办呢?SSRhunter只识别记事本格式啊,...