克隆获得一个花生的 NBS-LRR 类抗逆基因的全长序列,该基因与大豆抗病性蛋白 基因(KHN40407.1)的相似性为 79%,命名为 AhNDrp 基因.该基因不含内含子,cDNA 全长 2 832 bp,有 5 个典型的抗逆性蛋白 保守结构域,其中 Domain Ⅴ是富含亮氨酸的重复序列.荧光定量 PCR 分析表明,AhNDrp 基因在花生根中特异性表达...
番茄核苷酸结合位点(NBS)-亮氨酸富集重复(LRR)型抗病基因同源序列的分离与分析
要被分成两大类,一类是在编码蛋白N端包含一个TIR(Tollandinterleukin-1receptor)结构,称作TIR-NBS-LRR类型基因;其他类型的NBS-LRR类基因并不编码TIR结构区域,称之为非TIR-NBS-LRR类型基因,而这一类基因往往在它的N-端带有一个卷曲螺旋结构(Coiled-coil,CC),也称做CC-NBS-LRR类型基因。
花生中一个NBS-LRR类基因的克隆和表达分析赵小波1,张廷婷1,闫彩霞1,张浩1,2,单世华1*,陈殿绪1*(1.山东省花生研究所,山东青岛 266100;2.山东农业大学,山东泰安 271018) 摘要:本研究利用同源克隆方法,根据已知植物抗病(R)基因保守结构域设计一对简并引物,采用RT-PCR方法对花生抗旱品种J11进行扩增,获得了一个...
评述与展望ReviewsandProgress植物NBS-LRR抗病基因的结构、功能、进化起源及其应用刘云飞1,2万红建2李志邈2叶青静2王荣青2阮美颖2姚祝平2周国治2韦艳萍1,2杨悦俭2*1南京农业大学园艺学院,南京,210095;2浙江省农业科学院蔬菜研究所,杭州,310021*通讯作者,ztomato@126摘要NBS-LRR(nucleotidebindingsite-leucinerichrep...
番茄NBS_LRR抗病基因家族全基因组分析
Kinase-2a典型NBS类R基因保守结构域;核苷酸序列相似性为41.5%～ 98.8%,氨基酸序列相似性为21.5% ～100.0%;利用NCBI Blast同源搜索发现,与其他植物尤其是冬瓜、黄瓜、葫芦及丝瓜的已知R基因具有40%～100%相似性;氨基酸序列聚类分析将其分为5个组;同源进化分析表明,23条瓠瓜RGAs均为non-TIR-NBS-LRR类R基因,与推导...
多数 NBS-LRR 类家族基因定位在 8 号染色体。 在谷子中 NBS 结构域存在 4 段保守序列,且该家族在系统进化中被分为 3 类,基因结构多样,保守基序 Motif1 结构最保守。 有 23 个谷子NBS-LRR 类基因与狗尾草存在共线性,21 个与水稻存在共线性,仅 1 个与拟南芥存在共线性,其中 Seita. 8G088500 和 Seita. ...
摘要: NBS-LRR类基因家族是植物抗病R基因(Resistance gene)数量最多的一类, 具有NBS (Nucleotide-binding site)和LRR (Leucine-leucine-repeat)结构域。甘薯(Ipomoea batatas)栽培种基因组已完成测序, 但尚未注释, 本研究对甘薯 基因组序列进行外显子预测, 得到甘薯染色体组全基因组蛋白序列, 在此基础上进一步对NBS...
菠菜NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆及分析