肿瘤内异质性(ITH)促进了肺癌的发展、演进和迁移,从而导致肿瘤免疫逃逸和对治疗的抵抗性。该研究使用配对全外显子组和RNA测序数据,研究了354例非小细胞肺癌肿瘤的瘤内基因组-转录组多样性。 该研究对947个原发和转移性肿瘤区域以及96个肿瘤邻近正常组织样本的分析表明,转录组改变是表型变异的主要来源。基因表达水平...
这一工作阐明了全基因组加倍、基因组拷贝数不稳定对非小细胞肺癌复发的时间和模式进行预测重要性，并提供了全面的临床癌症进化的数据库资源。四、肺癌与转移的基因组与转录组进化 第四篇工作来自英国伦敦大学Nicholas McGranahan研究组与Charles Swanton研究组的合作，题为Genomic–transcriptomic evolution in lung can...
这一工作阐明了全基因组加倍、基因组拷贝数不稳定对非小细胞肺癌复发的时间和模式进行预测重要性,并提供了全面的临床癌症进化的数据库资源。 四、肺癌与转移的基因组与转录组进化 第四篇工作来自英国伦敦大学Nicholas McGranahan研究组与Charles Swanton研究组...
对代表原发性和转移性疾病的 947 个肿瘤区域以及 96 个与肿瘤相邻的正常组织样本的分析表明转录组是表型变异的主要来源。研究者还结合了多种机器学习方法，利用基因组和转录组变量将转移播种潜力与原发肿瘤区域内突变和增殖增加的进化背景联系起来。这些结果突出了基因组和转录组在影响 ITH、肺癌进化和转移方面的相互...
研究结果强调了选择在未经治疗的原发性肿瘤内的转移性克隆进化中的重要性,单克隆与多克隆播种在决定复发部位的区别,目前针对早期分化肿瘤的放射学筛查方法的局限性以及制定靶向转移策略的必要性。 原发瘤和转移瘤的基因组与转录组进化 03 该研究使用成对的全外显子组和 RNA 测序数据,调查了354 个非小细胞肺癌肿瘤...
原发瘤和转移瘤的基因组与转录组进化 03 nature.com/articles/s41该研究使用成对的全外显子组和RNA 测序数据,调查了 354 个非小细胞肺癌肿瘤的肿瘤内转录组学多样性。对代表原发性和转移性疾病的 947 个肿瘤区域以及 96 个与肿瘤相邻的正常组织样本的分析表明转录组是表型变异的主要来源。研究者还结合了多种...
肺癌和转移灶的基因组-转录组演变 (导读 领研网)本研究调查了来自TRACERx项目347名患者的354例非小细胞癌肿瘤的肿瘤间转录多样性,观察到与表观遗传功能障碍相关的拷贝数独立的等位基因特异性频繁表达,同时也导致基因组-转录组平行演化。结果强调了影响ITH,肺癌演变和转移灶的基因组与转录组之间的相互作用。] ...
通过对原发性/转移性肿瘤进行表征,并结合多种基于机器学习的方法,研究人员利用基因组和转录组中的变量将肿瘤的转移-播种潜力与原发性肿瘤区域内突变的进化背景以及增殖性增强联系了起来。这些结果突显了基因组和转录组在影响ITH、肺癌进化和转移方面的相互作用。
肿瘤的异质性还表现在RNA和DNA变异方面的丰度差异,研究人员从这个角度出发,利用全外显子组测序技术和RNA测序,对347份肺癌样本进行了分析,这些样本来自原先参加TRACERx研究的421名患者。研究人员旨在寻找肿瘤内异质性与mRNA转录组的多样性或基因表达变化之间的联系。
Science Advances|利用深度学习发现癌症中的新基因突变 Nature|肿瘤微环境的多组学机器学习预测乳腺癌治疗反应 Nature|肺癌和转移瘤中的基因组-转录组进化 Nature Methods |用深度多任务神经网络探索单细胞数据 JCIM|利用深度学习进行基于结构的从头药物设计 Journal of Medicinal Chemistry报道基于靶标结构的深度学习全新药物...