cDNA合成:通过反转录酶将RNA转化为cDNA。 文库构建:将cDNA片段接上适配器,构建测序文库。 高通量测序:利用Illumina、PacBio等平台对cDNA文库进行测序。 数据分析与比对:通过比对软件将获得的reads与参考基因组或转录组数据库比对,进行基因表达定量、差异分析、变异检测、剪接变异分析等。 结果解释:通过生物信息学分析揭示...
1)基因组、转录组、蛋白质组 genome 基因组 机体的一组完整的基因, 包括每条染色体(chromosome)的序列和细胞器(organells)中的任何 DNA。 transcriptome 转录组 转录组是存在于细胞、组织或生物体中的完整的 RNA 集合,包括编码 RNA 和非编码 RNA。 proteome 蛋白质组 ...
基因组转录组基因组转录组 基因组和转录组是生物体中两个重要的组成部分。 基因组指的是生物体的所有基因组合,包括DNA序列和可能存在的RNA转录本。在真核生物中,基因组包括细胞核、线粒体等细胞器中的DNA和RNA。 转录组是细胞内核糖核酸(RNA)转录本的总补体,由编码和非编码RNA组成。 基因组学和转录组学的研究...
而转录组则会随着环境条件的变化、生物体发育的不同阶段、不同组织和细胞的差异而变化。 技术方法:基因组学主要使用的技术包括全基因组测序、基因组比较等,而转录组学则主要使用的技术包括RNA测序(RNA-Seq)和DNA微阵列等。 应用领域:基因组学和转录组学的应用领域有一些交叉,但基因组学主要用于疾病诊断和治疗、农...
转录组的活跃程度不同,代谢组的物质种类多样。基因组是稳定的编码,蛋白质组具有更多的可变性。转录组体现基因表达的中间状态,代谢组是最终代谢的结果。蛋白质组研究蛋白质间相互作用,基因组是基因的集合。代谢组反映细胞内外的物质交流,基因组决定生物的基本特征。基因组是固定的信息库,转录组是信息的转录输出。 蛋白...
对于无参物种或参考基因组不完善的物种,想要开展基因调控机制研究,往往在进行转录组测序后,将得到的数据与近缘种的参考基因组比对,或借助Trinity拼接成Unigenes后与NR、Swissprout、KEGG等公共数据库完成基因定性。然而,在物种的演化进程中,即便属于同属物种,其基因组也存在一定的差异性。尤其在“种”的选育培育过程,...
转录组是一种描述基因表达的方式,它记录了在特定条件下,生物体内的哪些基因被转录成RNA。RNA是DNA的复制品,它可以作为蓝图用来合成蛋白质,也可以直接参与细胞的生物学过程。因此,转录组反映了生物体内基因活动的实际状态。在不同的生理和环境条件下,转录组会发生变化,这有助于生物体适应不同的情境。转录组的...
多组学联合分析(一)——基因组和转录组联合分析 随着测序技术的发展,单一组学的分析往往不能很好地解释生物学问题,此时多组学的联合分析应运而生。在疾病研究领域,可能涉及到组学数据有,基因组,外显子组,转录组,表观组,蛋白组或代谢组等。通过不同组学的数据相互补充,相互关联,缩小研究基因的范围,找到更有可能的...
转录组是指一个细胞或组织中所有mRNA的总和,它代表了实际上正在生产的蛋白质的信息。相反,基因组代表了整个细胞或生物体中的全部基因序列。 转录组和基因组的区别在于它们所代表的信息的不同。转录组代表了实际上正在生产的蛋白质的信息,因为只有翻译成蛋白质的mRNA才会被计入其中。相反,基因组代表了整个基因序列,...
首先是基因组转录组分析技术,这就像是一个 “基因探测器”,可以帮助研究人员全面了解基因的表达情况;其次是基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA),它能够找出与隐睾症相关的基因本体(Gene Ontology,GO)术语和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopaedia of Genes and Genomes,KEGG)通路;最后,研究人员还...