Nature子刊:微生物食品革命(综述)Nature Communications——[17.694] 微生物在食物生产和保藏中应用历史悠久; 与传统食品相比,微生物营养成分丰富而且更加健康; 增强发酵、合成生物学改善蛋白组分、发展肉蛋类、乳制品替代品,发展微生物饲料等是当前涌现的新型技术;
宏基因组分箱(Binning)方法是实现从测序数据中直接获取微生物基因组最为重要的分析技术之一,其可对微生物“暗物质”及其功能进行资源化,为挖掘未知的微生物功能类群(如肠道疾病治疗、环境修复可用类群等),并解析它们潜在的具有药用或环境价值的生物...
Nature子刊:Greengenes2或可实现扩增子和宏基因组结果一致? Nature Biotechnology——[46.9] ① 使用16S rRNA和宏基因组学的研究通常会产生不同的结果,通常归因于PCR扩增偏差;② 构建了一个名为Greengenes2的新参考数据库,可比较组合和统一来自16S rRNA或宏基因组测序的微生物组数据;③与SILVA相比,Greengenes2的系统...
Nature子刊:如何进行微生物组管理(观点) Nature Microbiology[IF:30.964] ① 微生物作为连接生态系统中实体的中介,可对整个系统产生即时影响;② 微生物组的管理包括调控特定微生物及其代谢、补充原生或非原生微生物、操纵基质改变微生物...
该研究提出并验证了针对微生物组的数据驱动研究范式,用微生物群落的物种组成来准确预测外源物种的定殖结果,进而可以通过引入关键物种来实现群落功能的精准调控。 首先,研究团队通过广义Lotka-Volterra模型的解析推导和计算模拟,证明了在训练数据量与微生物群落物种多样性相当的情况下,随机森林、神经常微分方程等机器学习模型...
该研究利用MscT技术,通过基于BGMGM的泛基因组功能基因比对策略,揭示了瘤胃微生物生态系统原位活性代谢功能类群。 浙江大学动物科学学院奶业科学研究所孙会增课题组与浙江大学良渚实验室王永成课题组合作,在 Nature Microbiology 期刊发表了题为:Single-cell transcriptomics across 2,534 microbial species reveals functional he...
真菌是否有上述类似的作用,是否应该被包括在癌症“hallmarks”多态微生物群落中尚不清楚,这就推动了泛癌真菌群落的表征。 真菌和细菌之间存在共生和拮抗关系,进一步促进了对它们在肿瘤中的相互作用的研究。发表在Nature Microbiology(IF:30.96)杂志中的文章表明,将真菌和细菌的信息结合起来可提供对结直肠癌(CRC)的协同诊...
病毒和非主要宿主之间的这些相互作用具有广泛的生态和进化意义，可以促进微生物和病毒基因的多样化，增加适应性免疫的选择性优势。图4 宿主-病毒相互作用的四种模型 阅读原文 Viruses interact with hosts that span distantly related microbial domains in dense hydrothermal mats.nature microbiology,2023 ...
发表期刊:Nature Microbiology 发表时间:2023 影响因子:28.3 DOI:10.1038/s41564-023-01426-7 在过去的二十年里,人们对人类微生物组研究的兴趣呈指数级增长,同时伴随而来的一系列相关研究的文献发表数目也是逐年递升。当我们的大脑充斥着这些海量的研究结果时,很容易就忽略了一些问题,比如这些研究结论是否都是已经证实...