Nanodrop和琼脂糖凝胶电泳是评估RNA质量的两种互补方法。Nanodrop可以快速检测RNA的纯度和浓度，而琼脂糖凝胶...
为了探究这一现象，有人在不同比例下将RNA混入100ng/μL的DNA中，并利用NanoDrop进行了检测，从而得出了以下实验结果：可见，即便DNA样品中RNA的残留量超过了实际DNA量的50%，A260/A280的比值仍然被认为处于正常范围内。因此，单凭A260/A280的比值来判断是否存在RNA残留是不够全面的。另一方面，若DNA样品的A260/A...
NanoPlot -t 4 --fastq ERR2778177.fastq.gz --plots hex dot 1. 2. 结果依然是类似于fastq质控报告的一个函数,不过统计指标少了几个,有两个把reads长度和质量分布放在一起的图不错。 #去接头,4线程,这一步耗时以小时计,对于我的五年前的双核心四线程笔记本 porechop -t 4 -i input.fastq -o trimmed...
导致比值偏高的可能原因有：1. DNA中的RNA残留：在提取基因组DNA时（例如从细菌中），尽管会加入RNase并在37℃下孵育10分钟来去除RNA，但不同细胞的特性可能导致RNA无法完全去除。研究显示，即使只有50%的RNA残留，A260/A280比值仍可能处于可接受范围内，因此该比值并不能明显指示RNA的存在。为解决此问题，可以延长...
NanoDrop 2000NanoDrop来检测RNA的纯度。我们都知道,纯的RNA其A260/A280接近于2。A260/A280是一个给大家带来许多困惑的指标。首先要明确该指标用于核酸的原始含义是:纯的RNA,其A260/280 = 2.0 左右。纯RNA是‘因’,A260/A280 = 2是‘果’。现在大家...
因此,“pure”dsDNA通过测定得出我们熟知的几个数值:A260=1相当于50ng/µl;A260/280≈1.8;A260/A230≈2.0-2.2。类似地,“pure”RNA亦有类似数据。此数据被用于浓度评测和核酸纯度分析。 然而,仪器厂家深知上述数据的偏差性,所以资料显示比值仅作为样本质量的参考指标,最佳的评测指标是后续的实验应用。
因此，尽管NanoDrop可以提供关于RNA样品纯度和浓度的有用信息，琼脂糖凝胶电泳仍然是验证RNA完整性和质量的...
在DNA提取过程中，通过添加RNase以去除RNA，尽管如此，不同细胞的特性导致了RNA残留的可能性。Giron Koetsier等人的研究指出，RNA污染会增加DNA浓度，同时导致A260/A280比值增加。尽管RNA比例的增加会提升比值，但当RNA含量达到50%时，A260/A280比值仍可保持在1.99，这表明根据比值判断RNA残留并不明显。...
综上所述,保障大型海藻 DNA 的质量对于获取高质量的研究数据有着至关重要的意义。在整个研究过程中,我们看到从大型海藻中提取 DNA 时,极易伴随多糖、多酚以及 RNA 等杂质,这些杂质会对后续的 qPCR 或者新一代测序(NGS)等实验产生诸多不利影响,比如影响 DNA 浓度和纯度判断的准确性,甚至导致实验无法顺利开展。