BHLH结合域序列是一段特定的氨基酸序列,通常由约60个氨基酸组成,其中的核心序列为“DNA-binding domain”。这个序列具有与DNA结合的能力,从而调控基因的表达。BHLH结合域的主要作用是识别和结合DNA上的特定序列,进而调控下游基因的表达。 在MYB基因中,BHLH结合域序列通常位于MYB蛋白的N端或C端,具有不同的结构和功能。
转录因子的一个特点是它包含一个或多个DNA结合域(DNA-binding domain, DBDs),通过这些结合域与基因附近的DNA序列结合,从而完成调控。其他蛋白,如共激活因子(coactivators),染色质重构因子(chromatin remodelers),组蛋白乙酰化酶(histone acetylases),去乙酰化酶(deacetylases),激酶(kinases)和甲基化酶(methylases),虽然...
Bioinformatics is a way that the researcher compares different plant species to find similarities and differences between them. MYB is a transcription factor family that has well-known functions in many plants, especially Arabidopsis. DNA-binding domains are pieces of pep...
植物的转录因子类型丰富,形成了不同的家族,其中以MYB、WRKY、AP2/ERF等转录因子家族最为庞大。MYB转录因子因N-端含有一段MYB保守结构域被命名,根据含有DNA结合域(DNA-bindingdomain)的数量被分为不同的亚群,如1R-MYB、R2R3-MYB、3R-MYB和...
MYB作为植物中最大的转录因子家族之一,含有DNA结合结构域(DNA-binding domain, DBD)、转录调控区(transcription regulation domain, TRD)、寡聚化位点(oligomerization site, OS)和核定位信号(nuclear location signal, NSL)。该类转录因子通过DBD与下...
MYB作为植物中最大的转录因子家族之一,含有DNA结合结构域(DNA-binding domain, DBD)、转录调控区(tranion regulation domain, TRD)、寡聚化位点(oligomerization site, OS)和核定位信号(nuclear location signal, NSL)。该类转录因子通过DBD与下游靶基因启动子区域的顺式作用元件相结合,调控下游靶基因的表达,从而转导...
这些保守性较高的氨基酸残基很可能与保守的色氨酸残基共同维持花生MYB转录因子的DNA结合域结构,保证转录因子的功能。总体而言,在MYB结构域识别位点的保守性上,R1结构域的保守性最低,R3结构域保守性较高,R2结构域保守性最高。 图2(Figure 2) 图2 花生MYB转录因子DNA结构域Figure 2 DNA binding domain of MYB ...
The cavity in the hydrophobic core of Myb DNA- binding domain is reserved for DNA recognition and trans- activation. Nat Struct Biol 3, 178–187. Pabo CO, Sauer RT (1992). Transcription factors: structural families and principles of DNA recognition. Annu Rev Bio- chem 61, 1053–1095. Paz...
随着分子生物学的发展,近年来通过正向遗传学的方法得到了烟草、拟南芥和水稻绒毡层、花粉发育相关的T2DNA插入和理化诱变突变体,分析并克隆到了一些调控绒毡层形成、发育及在小孢子发育过程中起重要作用的相关基因,使我们进一步认识了花药绒毡层以及花粉发育的分子机制[12]。 对花药绒毡层结构、物质、发育过程及相关...
MYB转录因子是植物中最大的转录因子家族之一,近年的研究表明其广泛参与多种生物学过程.MYB转录因子在其N端含有其特有的DNA结合基序(MYB-binding domain),能够与DNA分子大沟结合而调控基因表达.本研究通过生物信息学手段,在全基因组水平上筛选鉴定出了304个大豆MYB类转录因子,并对其进行了分类和保守结构域分析;通过与...