将MYB氨基酸序列提交至Weblogo(http://weblogo.threeplusone.com/create.cgi)[19],获得MYB基因结构域的序列标识,依据其所含DNA结合域的数目对枣树MYB分类。根据骏枣基因组中的MYB基因在染色体上的分布位置信息,利用TBTools(v1.082)[20]绘制基因...
MYB家族基本结构是N端的DNA结合域和C端的可变转录激活域,主要在调节基因表达、木质素合成和后硬度等方面发挥作用。MYB家族成员还可以通过与其他基因调控网络的交互作用,调节植物对病原菌、盐碱性和干旱的应对能力。在其他植物中,MYB家族成员也很常见,参与了这些植物生长发育和适应环境的过程,值得进一步深入研究。
转录因子的一个特点是它包含一个或多个DNA结合域(DNA-binding domain, DBDs),通过这些结合域与基因附近的DNA序列结合,从而完成调控。其他蛋白,如共激活因子(coactivators),染色质重构因子(chromatin remodelers),组蛋白乙酰化酶(histone acetylases),去乙酰化酶(deacetylases),激酶(kinases)和甲基化酶(methylases),虽然...
其中,MYB结合域是MYB蛋白的保守结构域,具有与DNA结合的能力,从而调控基因的表达。而BHLH结合域是MYB结合域中的一种类型,在MYB基因中起着至关重要的作用。 BHLH结合域序列是一段特定的氨基酸序列,通常由约60个氨基酸组成,其中的核心序列为“DNA-binding domain”。这个序列具有与DNA结合的能力,从而调控基因的表达。
多序列比对显示,RcMYB1包含典型的bHLH相互作用基序、ANDV基序和保守的R2R3 MYB DNA结合结构域[R/K]Px[P/A/R]xx[F/Y]基序(图S2)。结果表明,RcMYB1可能是玫瑰花青素生物合成的激活剂。 为了研究RcMYB1在玫瑰花瓣着色过程中的转录谱,我们选择了“Old Blush”花七个发育阶段的花瓣(S1–S7)(图1A),并测定了...
MYB转录因子的命名源于其特有的DNA结合域——MYB结构域,该结构域由一系列不完全重复的R(repeat)单元构成,每个R单元约包含51-53个氨基酸,通过形成螺旋-转角-螺旋(helix-turn-helix)结构来特异性地识别并结合DNA序列。 根据MYB结构域的数量和序列特征,植物MYB基因家族通常被分为四大类:R1/2-MYB、R3-MYB、MYB-...
螺旋结构:R2和R3结构域通常由多个α螺旋组成,这些螺旋通过氢键相互作用,形成一个紧密的结构。DNA结合...
MYB转录因子以保守的DNA结合域为共同特征,是植物最大的转录因子家族之一,广泛参与植物代谢调控。本文根据植物中MYB转录因子的DNA保守结构域,通过RT-PCR和RACE的方法从大豆品种吉林3号的叶片中分离得到了2个MYB基因GmMYBJ6和GmMYBJ7,并对其结构特征和表达特性进行了分析鉴定。基因组DNA序列分析表明,两个基因...
MYB 类转录因子的得名是因其结构上都有一段保守的 DNA 结合区,即 Myb 结构域。大多数 MYB 蛋白在 N 端含有一段氨基酸残基组成的 Myb 结构域,根据这个高度保守的结构域的结构特征可将 MYB 转录因子分为四个亚类:1R-MYB/MYB-related;R2R3-MYB;3R-MYB;4R-MYB (4个 R1/R2 的重复)。R 结构是由 50 ...
MYB (MYB proto-oncogene, transcription factor) 该基因编码一种具有三个HTH-DNA结合域的蛋白质,作为转录调节器。这种蛋白在造血调节中起着重要作用。该基因可能在白血病和淋巴瘤中异常表达、重排或易位,被认为是癌基因。选择性剪接导致多个转录变体。 This gene encodes a protein with three HTH DNA-binding domain...