本研究基于转录组数据鉴定了多刺绿绒蒿MYB转录因子家族成员,对其理化性质、二级结构、保守基序、系统进化关系和表达模式进行分析,并预测了部分多刺绿绒蒿MYB转录因子的功能,筛选出可能参与黄酮类代谢及非生物胁迫等方面的MYB转录因子,为进一步揭示和深入研究MYB转录...
本研究基于转录组数据鉴定了多刺绿绒蒿MYB转录因子家族成员,对其理化性质、二级结构、保守基序、系统进化关系和表达模式进行分析,并预测了部分多刺绿绒蒿MYB转录因子的功能,筛选出可能参与黄酮类代谢及非生物胁迫等方面的MYB转录因子,为进一步揭示和深入研究MYB转录因子在多刺绿绒蒿的生长发育、次生代谢及胁迫响应机制等方...
蛋白的转录后调控相关.磷酸化位点分析发现JcMYB-CC1,JcMYB-CC2和其余物种的同源蛋白在MYB-DNA结合域中的相同位点存在2个苏氨酸磷酸化位点(T)和1个丝氨酸磷酸化位点(S),在CC结构域的同一位置有1个酪氨酸磷酸化位点(Y),JcMYB-CC3,JcMYB-CC4在MYB-DNA结合域中只有1个苏氨酸磷酸化位点(T),在CC结构域中磷酸...
MYB-CCs是一种特殊的转录因子家族蛋白,表现在它同时含有MYB-DNA结合域和二聚体CC (Coiled-coil)结构域,后者以折叠的方式在蛋白质互作中发挥重要作用.本研究对棉属中的陆地棉,海岛棉,亚洲棉和雷蒙德氏棉进行了基因组分析,分别鉴定到了46,47,22,23个MYB-CC基因,并利用生物信息学方法分析了这些基因的特征,染色体...
因此可以推测,MYB转录因子可以通过与CS启动子序列中的MYB结合位点结合,产生互作,激活或者抑制辣椒素合成酶基因(CS)的表达,影响辣椒素合成途径,最终影响了辣椒素的合成。本研究通过PCR技术在黄灯笼椒中获得一个MYB转录因子基因,命名为Ccmyb,全长1038bp,编码345个氨基酸。 经过网站预测分析,Ccmyb包含有两个螺旋-转角-...
MYB转录因子可以通过互作作用、信号转导和基因表达调控等方式,对植物的生长发育进行调节。 互作作用 MYB转录因子可以通过与其他转录因子的互作作用,实现对植物生长发育过程的调节。例如,MYB48可以通过与磷酸化酰化酶PPE1互作,调节根尖发育,使其向下生长,从而增加植物对土壤中的养分吸收。而MYB88则可以通过与调节分裂素...
谷子MYB-CC基因家族的鉴定与表达分析
54 No. 5 示(图 1),多刺绿绒蒿 MYB 转录因子蛋白主要注 释在细胞成分(cellular component,CC),生物过 程(biological process,BP),和分子功能(molecular function,MF)3 大类.GO 富集分析结显示,MYB 转录因子蛋白功能在细胞成分(cellular component, CC)方面主要富集在细胞核(GO:0005634),细 胞上细胞器(GO:...
转录因子通常是一种模块化的蛋白,一般由几个独立的功能域组成,包括DNA 结合功能域,转录激活功能域,蛋白 蛋白相互作用功能域,信号分子结合功能域,核定位信号区等。根据DNA 结合功能域的结构,转录因子可分为以下几类:bHLH (碱性螺旋 环 螺旋)、bZIP (碱性亮氨酸拉链)、homeodomain 蛋白、MADS box 蛋白、zinc ...
2 植物 MYB 的作用方式 植物在生长发育过程中,会根据外界环境的变 化而及时调整适应策略.MYB 在转录水平上调控植 物细胞内稳态平衡和对逆境胁迫的耐受性,作用方 式包括受到激活作用后直接作用于下游应答靶基因 的转录调节位点,或与上下游因子互作后传递信号 以及整合多信号通路响应逆境(图 3). 2.1 MYB与上下游...