VMD用的是1.9.3版，可以在http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/免费下载。各种量子化学程序产生的...
关闭窗口后还可以选2导出cub文件，然后可以用《在VMD里将cube文件瞬间绘制成效果极佳的等值面图的方法》...
然后调整它的大小和位置,即双击VMD Main窗口中Color Scale Bar那一项当中的F标签使之变为红色(即不让色彩刻度轴在画面中的位置冻结),而双击其它项目的F标签使它们的F变为黑色(让它们的位置冻结住)。然后点击VMD的OpenGL图形窗口激活之,按t键进入平移模式,然后拖动鼠标将色彩刻度轴放置到合适位置,并且用鼠标滚轮调...
1.Multiwfn+VMD,在入门手册中都可以找到 (1) Lu, T.; Chen, F., Multiwfn: a Multifunctional Wavefunction Analyzer. J. Comput. Chem. 2012, 33, 580-592.(2) Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K., VMD: Vis…
Multiwfn可以在其主页http://sobereva.com/multiwfn免费下载,如果对Multiwfn不了解的话强烈建议阅读《Multiwfn入门tips》(http://sobereva.com/167)。VMD用的是1.9.3版,可以在http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/免费下载。各种量子化学程序产生的.fch/fchk、.molden、.mwfn文件以及GAMESS-US或Firefly程序的输出...
登录 下载App4392 9 06:27 Multiwfn+VMD绘制HOMO和LUMO轨道-简洁过程.mp4贱小贱0220 立即播放 打开App,流畅又高清100+个相关视频 更多 2.0万 2 03:57 App Multiwfn+VMD绘制比较高级的HOMO/LUMO轨道 9398 23 16:20 App Multiwfn+VMD绘制HOMO和LUMO轨道-非常详细 2.9万 2 08:34 App 【科研绘图】绘制高级分子...
本视频演示如何使用Multiwfn结合VMD利用脚本非常简单、快速地绘制效果很理想的静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图。看本视频后请务必阅读对应的文章《使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图》http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html。若有问题也可以跟帖提问。视频...
最后绘制的效果如下。为了凸显(3,-3)临界点,它的size由默认的11改为 了20。 上图用的是黑色背景,临界点位置看得很清楚,但是如果用白色背景(命令行窗口输入co or Dis y Background white), 临界点的颜色应该用得深一些。 接下来显示键径。 把paths.pdb拖进VMD Main 下载文档 收藏 分享 赏 0...
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布文Sobereva2013Jul281 前言分子表面静电势图经常在文献中出现,不同表面区域静电势大小通过不同颜色展现,使分子表面上静电势的分布一目了然。分子表面一般都用Bader定义
本文介绍的通过Multiwfn的定量分子表面分析功能结合VMD和photoshop作分子表面静电势图既不比使用Gaussview快,步骤也比它复杂,但是优点十分显著,就是可以在分子表面上显示出静电势极值点位置,可以十分灵活地调节显示效果,而且还可以通过相同的方法绘制出分子表面上静电势以外的实空间函数的分布,比如平均局部离子化能、局部...