mgatk），可以通过mtscATAC-seq对复杂的细胞群体中的克隆结构进行鉴定以及通过高通量的、高质量的方法对单细胞状态相关的线粒体DNA变体进行分析。另外，作者们也使用mtscATAC-seq技术对体内和体外的造血干细胞谱系进行克隆追踪。
进一步地,作者们建立了一个线粒体基因组分析工具箱(Mitochondrial Genome Analysis Toolkit,mgatk),可以通过mtscATAC-seq对复杂的细胞群体中的克隆结构进行鉴定以及通过高通量的、高质量的方法对单细胞状态相关的线粒体DNA变体进行分析。另外,作者们也使用mtscATAC-seq技术对体内和体外的造血干细胞谱系进行克隆追踪。 总...
近日,北京华大生命科学研究院与大连妇幼保健院在Aging Cell期刊上发表了题为Single-cell mitochondrial sequencing reveals low-frequency mitochondrial mutations in naturally aging mice的研究论文。该论文提出了一种新的单细胞线粒体测序技术—...
进一步地,作者们建立了一个线粒体基因组分析工具箱(Mitochondrial Genome Analysis Toolkit,mgatk),可以通过mtscATAC-seq对复杂的细胞群体中的克隆结构进行鉴定以及通过高通量的、高质量的方法对单细胞状态相关的线粒体DNA变体进行分析。另...
NBT报道了一项创新的单细胞线粒体DNA基因分型与染色质分析技术——mtscATAC-seq。该技术由哈佛医学院和Broad研究所等研究团队合作开发，旨在解决大规模并行处理复杂人体组织中线粒体DNA与细胞状态分析的挑战。传统的scATAC-seq方法在处理线粒体时效率低下，mtscATAC-seq通过优化液滴技术的工作流程，采用特定...
进一步地,作者们建立了一个线粒体基因组分析工具箱(Mitochondrial Genome Analysis Toolkit,mgatk),可以通过mtscATAC-seq对复杂的细胞群体中的克隆结构进行鉴定以及通过高通量的、高质量的方法对单细胞状态相关的线粒体DNA变体进行分析。另外,作者们也使用mtscATAC-seq技术对体内和体外的造血干细胞谱系进行克隆追踪。
使用Seurat/Signac R 包分析 mtscATAC-seq 的 mtDNA变异 适合多种形式 ReadMGATK从 mgatk 输出中导入文件,并将它们存储在Seurat对象中; IdentifyVariant利用 mtscATAC-seq 库上的链一致性和 VMR 统计来鉴定高质量的亚克隆变异; FindClonotypes从前面的函数中获取高置信度的变体,然后通过异质空间中的细胞-细胞邻居...
进一步地,作者们建立了一个线粒体基因组分析工具箱(Mitochondrial Genome Analysis Toolkit,mgatk),可以通过mtscATAC-seq对复杂的细胞群体中的克隆结构进行鉴定以及通过高通量的、高质量的方法对单细胞状态相关的线粒体DNA变体进行分析。另外,作者们也使用mtscATAC-seq技术对体内和体外的造血干细胞谱系进行克隆追踪。
进一步地,作者们建立了一个线粒体基因组分析工具箱(Mitochondrial Genome Analysis Toolkit,mgatk),可以通过mtscATAC-seq对复杂的细胞群体中的克隆结构进行鉴定以及通过高通量的、高质量的方法对单细胞状态相关的线粒体DNA变体进行分析。另外,作者们也使用mtscATAC-seq技术对体内和体外的造血干细胞谱系进行克隆追踪。