mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS)作用:通过对多个表型相似的GWAS summary结果进行联合分析,发现更多的表型相关基因座。 以抑郁症状、神经质和主观幸福感这三个表型为例,分别对他们进行GWAS分析,鉴定得到32、9 和 13个基因座与它们相关。当将这三者进行mtag分析后,则可发现64、37 和 49 个基因座与它们相关,...
GWAS分析一般针对于SNPs和单一性状之间的关联,从而导致与该性状相关的性状中包含的信息没有得到充分利用。相比于单表型的GWAS,MTAG可以利用关联表型的信息提升目标表型的检验统计power。 02 方法和原理 2.1 LDSC原理 2.2 MTAG原理 03 脚本和实操 3.1 LDSC代...
mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS)作用:通过对多个表型相似的GWAS summary结果进行联合分析,发现更多的表型相关基因座。 以抑郁症状、神经质和主观幸福感这三个表型为例,分别对他们进行GWAS分析,鉴定得到32、9 和 13个基因座与它们相关。当将这三者进行mtag分析后,则可发现64、37 和 49 个基因座与它们相关,...
mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS)作用:通过对多个表型相似的GWAS summary结果进行联合分析,发现更多的表型相关基因座。 以抑郁症状、神经质和主观幸福感这三个表型为例,分别对他们进行GWAS分析,鉴定得到32、9 和 13个基因座与它们相关。当将这三者进行mtag分析后,则可发现64、37 和 49 个基因座与它们相关,...
Type 2 Diabetes)中使用了MTAG方法,我就特别好奇这种方法的源头在哪里,就找到了2018年发表在Nature Genetic上的一篇文献 (Multi-trait analysis of genome-wide association summary statistics using MTAG),这篇文章介绍的MTAG的方法主要原理是:通过对多个表型相似的GWAS summary结果进行联合分析,发现更多的表型相关基因...
多性状基因组关联分析(MTAG)是一种新型的遗传统计方法,旨在通过联合分析多个性状来提高对遗传关联的检测能力。这种方法主要针对全基因组关联研究(GWAS)中常见的问题,即传统GWAS通常只针对单一性状,可能无法充分利用与其他相关性状间共享的遗传信息。 MTAG的主要特点和优势: ...
We introduce Multi-Trait Analysis of GWAS (MTAG), a method for joint analysis of summary statistics from GWASs of different traits, possibly from overlapping samples. We apply MTAG to summary statistics for depressive symptoms ( N eff = 354,862), neuroticism ( N = 168,105), and subjective...
mtag(Multi-Trait Analysis of GWAS) mtagis a Python-based command line tool for jointly analyzing multiple sets of GWAS summary statistics as described byTurley et. al. (2018). It can also be used as a tool to meta-analyze GWAS results. ...
mtagis a Python-based command line tool for jointly analyzing multiple sets of GWAS summary statistics as described byTurley et. al. (2018). It can also be used as a tool to meta-analyze GWAS results. Getting Started We recommend installing theAnaconda python distributionas it includes all of...
We introduce multi-trait analysis of GWAS (MTAG), a method for joint analysis of summary statistics from genome-wide association studies (GWAS) of different traits, possibly from overlapping samples. We apply MTAG to summary statistics for depressive symptoms (Neff = 354,862), neuroticism (...